Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,412,154 | G→A | C147C (TGC→TGT) | yfbU ← | PF03887 family protein YfbU |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,412,154 | 0 | G | A | 99.1% | 381.7 / ‑4.3 | 109 | C147C (TGC→TGT) | yfbU | PF03887 family protein YfbU |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (54/54); total (54/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TCCGTGGCCTCGATGTGCTCCAGACGCGTAAACTCGGCGGCAATATCAGCCTCGGATTTGCCCGCCATAAAATGGCGCAGAGAGGTGATCGCCTGTTTACCGTGAATGAAAGCCAGCACCTCTTCCGGCGCTAACCCATGACGTCTGGCCCAGTTGCTCCACGCCCGTTCTACCGCAGGCAGGGAATCCACCAGCGTTCCATCAAGATCAAACAGAAAACCTTTGCACCGCACGCGGGCCTCCTCAGGCATTGATAATTTGATTAATTTCGTTGGCGCTCAAATGGTACTGACGCGGGCAGGCATGCCACACATTAAGCATGCGCTGATATTTTTCCCACATTGGCGTCTGGGCGTTAAAACCGTGAGTTCCGGCGTCAAAATGGGTATAGCGCCCTTCCACATTAACCATAAAGCGGACATAACCGAGGTAACGTGCTTCAGTGGCGGCGTCAAAGCCGAGGAAGGTGACACGACGTTCATCGATGGATTGCTGGTCCTGCAAATTAGACCAGGAAACATGCAACGCATGATACATCTCCATAATGTCGATGATAGTGCGGCAGGTTTCTTCTTTCAGCTCGCCAAACT > NC_000913/2411857‑2412446 | ctgctagatgtgtataagagacagcgcgTAAACTCGGCGGCAATATCAGCCTCGGATTTGCCCGCCATAAAATGGCGCAGAGAGGTGATCGCCTGTTTACCGTGAATGAAAGCCAGCACCTCTTCCGGCGCTAACCCATGACGTCTGGCCCAGTTGCTCCACGCCCGTTCTACCGCAGGCAGGGAATCCACCAGCGTTCCATCAAGATCAAACAGAAAACCTTTGCACCGCACGCGGGCCTCCTCAGGCATTGATAATTTGATTAATTTCGTTGGCGCTCAAATGGTACTGACGCGggca > 1:403111/25‑300 (MQ=255) gCCTCGATGTGCTCCAGACGCGTAAACTCGGCGGCAATATCAGCCTCGGATTTGCCCGCCATAAAATGGCGCAGAGAGGTGATCGCCTGTTTACCGTGAATGAAAGCCAGCACCTCTTCCGGCGCTAACCCATGACGTCTGGCCCAGTTGCTCCACGCCCGTTCTACCGCAGGCAGGGAATCCACCAGCGTTCCATCAAGATCAAACAGAAAACCTTTGCACCGCACGCGGGCCTCCTCAGGCATTGATAATTTGATTAATTTCGTTGGCGCTCAAATGGTACTGACGCGGACAGGCATg > 1:809706/1‑300 (MQ=255) tCGATGTGCTCCAGACGCGTAAACTCGGCGGCAATATCAGCCTCGGATTTGCCCGCCATAAAATGGCGCAGAGAGGTGATCGCCTGTTTACCGTGAATGAAAGCCAGCACCTCTTCCGGCGCTAACCCATGACTTCTGGCCCAGTTGCTCCACGCCCGTTCTACCGCAGGCAGGGAATCCACCAGCGTTCCATCAAGATCAAACAGAAAACCTTTGCACCGCACGCGGGCCTCCTCAGGCATTGATAATTTGATTAATTTCGTTGGCGCTCAAATGGTACTGACGCGGACAGGCATGCca < 1:914244/300‑1 (MQ=255) tCGATGTGCTCCAGACGCGTAAACTCGGCGGCAATATCAGCCTCGGATTTGCCCGCCATAAAATGGCGCAGAGAGGTGATCGCCTGTTTACCGTGAATGAAAGCCAGCACCTCTTCCGGCGCTAACCCATGACGTCTGGCCCAGTTGCTCCACGCCCGTTCTACCGCAGGCAGGGAATCCACCAGCGTTCCATCAAGATCAAACAGAAAACCTTTGCACCGCACGCGGGCCTCCTCAGGCATTGATAATTTGATTAATTTCGTTGGCGCTCAAATGGTACTGACGCGGACAGGCATGCca < 1:923789/300‑1 (MQ=255) 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TCCGTGGCCTCGATGTGCTCCAGACGCGTAAACTCGGCGGCAATATCAGCCTCGGATTTGCCCGCCATAAAATGGCGCAGAGAGGTGATCGCCTGTTTACCGTGAATGAAAGCCAGCACCTCTTCCGGCGCTAACCCATGACGTCTGGCCCAGTTGCTCCACGCCCGTTCTACCGCAGGCAGGGAATCCACCAGCGTTCCATCAAGATCAAACAGAAAACCTTTGCACCGCACGCGGGCCTCCTCAGGCATTGATAATTTGATTAATTTCGTTGGCGCTCAAATGGTACTGACGCGGGCAGGCATGCCACACATTAAGCATGCGCTGATATTTTTCCCACATTGGCGTCTGGGCGTTAAAACCGTGAGTTCCGGCGTCAAAATGGGTATAGCGCCCTTCCACATTAACCATAAAGCGGACATAACCGAGGTAACGTGCTTCAGTGGCGGCGTCAAAGCCGAGGAAGGTGACACGACGTTCATCGATGGATTGCTGGTCCTGCAAATTAGACCAGGAAACATGCAACGCATGATACATCTCCATAATGTCGATGATAGTGCGGCAGGTTTCTTCTTTCAGCTCGCCAAACT > NC_000913/2411857‑2412446 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |