| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,443,674 | G→A | G208G (GGG→GGA) | ydbH → | putative phospholipid transport factor YdbH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,443,674 | 0 | G | A | 98.8% | 293.1 / NA | 84 | G208G (GGG→GGA) | ydbH | putative phospholipid transport factor YdbH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (45/38); minor base C (1/0); total (46/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCTCCAAAAACACTCGCGCAGTGGCAGGCCATGCTGCCTAACACCTGGATCAATATCGATAAACTGATTTTTTCTCCCTGGCAGGAATGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGCGGGCAATTGATCGTGCTGGCACGGGATAACGGCGATCCGTTGCTCGATTTGCCGTGGCAAATTACTCGTCAACAATTGACCGTAAGCGATGGTCGCTGGAGCTGGCCGTATGCAGGTTTTCCTTTGAGTGGCCGACTGGGTGTCAAAGTCGACAACTGGCAGGCAGGGCTTGAGAACGCTCTGGTCAGCGGACGACTGAGTGTGCTGACCCAGGGGCAAG > NC_000913/1443381‑1443969 | gCTCGAAAAACACTCGCGCAGTGGCAGGCCATGCTGCCTAACACCTGGATCAATATCGATAAACTGATTTTTTCTCCCTGGCAGGAATGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGTTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCt < 2:170906/300‑1 (MQ=255) tCCAAAAACACTCGCGCAGTGGCAGGCCATGCTGCCTAACACCTGGATCAATATCGATAAACTGATTTTTTCTCCCTGGCAGGAATGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCTAc < 1:103002/300‑1 (MQ=255) ccAAAAACACTCGCGCAGTGGCAGGCCATGCTGCCTAACACCTGGATCAATATCGATAAACTGATTTTTTCTCCCTGGCAGGAATGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGACCACGTTACATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCtcct > 2:403085/1‑297 (MQ=255) cAAAAACACTCGCGCAGTGGCAGGCCATGCTGCCTAACACCTGGATCAATATCGNTAAACTGATTTTTTCTCCCTGGCAGGACTGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCTACTg < 2:705880/300‑1 (MQ=255) 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tGGATCAATATCGATAAACTGATTTTTTCTCCCTGGCAGGAATGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCACCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGcc > 2:860450/1‑300 (MQ=255) ttttttCTCCCTGGCAGGAATGGCAGGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATa > 1:964424/1‑300 (MQ=255) tttttCTCCCTTGCAGGAATGGCATGGAAAACTCTCTCTCGCATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAGAGGTAGATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAATTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGTTGGGGGAATTTGCTATGCCGCTCGTTCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGACATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACGGGGGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGaaaagag < 1:617290/300‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |