| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,361,174 | C→T | L19F (CTT→TTT) | puuD → | gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,361,174 | 0 | C | T | 99.2% | 441.1 / NA | 124 | L19F (CTT→TTT) | puuD | gamma‑glutamyl‑gamma‑aminobutyrate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (38/85); total (39/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TCTCTACTTCAACGATATTGGTTTCCATGATTCTTCGCCTTTGGTTTGTTTTCCGCTCGTTATCAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTTGCCTATTGCGCTACCACATGCGCTGGCGGAACCGTCATTACTTGAACAACTTTTGCCGAAACTCGATGGCATTTATCTTCCTGGTAGTCCCAGCAATGTGCAGCCGCACCTATATGGTGAAAACGGCGATGAGCCTGACGCCGATCCCGGGCGTGATCTTCTGAGCATGGCGATAATTAATGCCGCACTCGAAAGGCGCATCCCCATTTTCGCCATCTGCCGGGGT > NC_000913/1360881‑1361467 | tctcTACTTCAACGATATTGTTTTCCATGATTCTTCGCCTTTGGTTTGTTTTCCGCTCGTTATCAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGANAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATNGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGTTTAAgg < 2:648727/300‑1 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gtgCAGGAACAGGTTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTTGCCTATTGCGCTACCACATGCGCTGGCGGAACCGTCATTACTTGAACAACTTTTGCCGAAACTCGATGGCATTTATCTTCCTGGTAGTCCCAGCAATGTGCAGCCGCACCTATATGGTGAAAACGGCGATGAGCCTGACGCCGATCCCGGGCGTGATCTTCTGAGCATGGCGATAATTAATGCCGCACTCGAAAGGCGCATCCCCATTTTCGCCATCTg > 1:198586/1‑300 (MQ=255) gAACAGGTTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTTGCCTATTGCGCTACCACATGCGCTGGCGGAACCGTCATTACTTGAACAACTTTTGCCGAAACTCGATGGCATTTATCTTCCTGGTAGTCCCAGCAATGTGNAGCCGCACCTATATGGTGAAAACGGCGATGAGCCTGACGCCGATCCCGGGCGTGATCTTCTGAGCATGGCGATAATTAATGCCGCACTCGAANGGCGCATCCCCATTTTCGCCATCTGCCgggg < 2:691628/300‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTTGCCTATTGCGCTACCACATGCGCTGGCGGAACCGTCATTACTTGAACAACTTTTGCCGAAACTCGATGGCATTTATCTTCCTGGTAGTCCCAGCAATGTGCAGCCGCACCTATATGGTGAAAACGGCGATGAGCCTGACGCCGATCCCGGGCGTGATCTTCTGAGCATGGCGATAATTAATGCCGCACTCGAAAGGCGCATCCCCATTTTCGCCATCTGCCGGGGt < 1:327512/300‑1 (MQ=255) | TCTCTACTTCAACGATATTGGTTTCCATGATTCTTCGCCTTTGGTTTGTTTTCCGCTCGTTATCAAAGCGTAAAATATAATGACCACCATTCGAATCTGTATGCAAACTAAATGTTTGTCAAATGTTAAATTGAGTTTGCAAAAATGAAAACCCACTGCTAGATTGAAAAAATATTGAACATAAAGGTCATTTAAAGCGCAGTAATGGCGATAATTTAGTCCACTTTGTGAGATTGAGCATGGAAAATATAATGAACAATCCGGTTATCGGTGTCGTAATGTGCAGGAACAGGCTTAAGGGTCATGCGACCCAGACTCTGCAAGAAAAGTACCTGAATGCCATCATCCATGCAGGCGGCTTGCCTATTGCGCTACCACATGCGCTGGCGGAACCGTCATTACTTGAACAACTTTTGCCGAAACTCGATGGCATTTATCTTCCTGGTAGTCCCAGCAATGTGCAGCCGCACCTATATGGTGAAAACGGCGATGAGCCTGACGCCGATCCCGGGCGTGATCTTCTGAGCATGGCGATAATTAATGCCGCACTCGAAAGGCGCATCCCCATTTTCGCCATCTGCCGGGGT > NC_000913/1360881‑1361467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |