| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,286,488 | IS1 (–) +9 bp | coding (640‑648/678 nt) | narI → | nitrate reductase A subunit gamma |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 97 (0.840) | 72/598 | 0.3 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1286488 = | 0 (0.000) | coding (640/678 nt) | narI | nitrate reductase A subunit gamma | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1286496 | 0 (0.000) | 85 (0.730) | 56/598 | 0.9 | 100% | coding (648/678 nt) | narI | nitrate reductase A subunit gamma |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CGTGCAACCACTACCGGAGCGGATATCCTGATCCTGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1286203‑1286496‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGT > NC_000913/1978503‑1978791 CGTGCAACCACTACCGGAGCGGATATCCTGATCCTGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTTACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAAT < 1:387936/300‑1 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ATCCTGATCCTGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCAGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGCGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCCGGTGCCGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGTGTACCGGTGGAGTATCTGCCACGTGGTCCTGACTACAACTTATTGCTAGTGTTT > 2:378075/1‑300 TGATCCTGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCANTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 1:639428/300‑1 GATCCTGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:723594/300‑1 taCTGTCGCTACTCGTTATCCAGTGCGCACTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCGCAGCATATGGACGGTAGCGGGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 2:36352/298‑1 TCCTGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:760101/1‑300 TGTCGCTGCTCGTTATCCAGTGCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:750551/300‑1 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GCGCGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAACATATGGACGTTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 2:116511/300‑1 aGCTGGGCGTGTTGACCATTCCGTGCTCCACTCAGCATATGGACGGTCGCTAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTTCTACTGTTCCCGTTCGCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGTTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAGGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:11424/299‑1 CGCTGGGCCTGTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCACCACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCACGATGACTTTGTCATGC > 2:355557/1‑300 GTTGACCATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG > 1:377343/1‑300 ATTCCGTTCTCCGCTCAGCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGA > 1:69085/1‑300 GCTCAGCATATGGACGGTAGCTAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA < 1:122780/300‑1 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GCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGNGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGNTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTACAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAAAGCGACTTCC > 2:658018/1‑300 GCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCCGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 1:420009/1‑300 GCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 1:540777/1‑300 GCATATGGACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCAAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCGTGCAGCTCAACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > 2:211254/1‑300 ACGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGC < 1:734872/300‑1 CGGTAGCGAGATGATGAAACTGGTTGGCTGGGCGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCC < 1:956590/300‑1 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ataGGCGCAGTCGGTATTGACCTTCCATGTTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGCTATGGCGTTCACCTTCCGGCTGCACCTGGTGCTGGGGACGACGTTATTCCTGCTATGCCCGTTTTCGCGTCTGATACACACCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCGGCTCCACTGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCCCAGATTCAGGT < 2:27465/297‑1 CGCAGTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGC < 1:458080/300‑1 GTCGGTGGTGACCTTCCACGGTGGCGCTTCTCAACACCTCGATGGTGTGGCGTTTATCTTCCGTCTGCACCTGGTGCTGGGGATGACGTTATTCCTGCTGTTCCCGTTCTCGCGTCTGATACACATCTGGAGCGTACCGGTGGAGTATCTGACACGTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCT > 1:630680/1‑300 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NC_000913/1286203‑1286496‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGT > NC_000913/1978503‑1978791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |