New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 780631 | 181 (1.870) | 13 (0.130) | 10/596 | 6.5 | 8.1% | intergenic (+2/‑134) | lysT/valT | tRNA‑Lys/tRNA‑Val |
? | NC_000913 | 780921 = | 115 (1.190) | intergenic (+3/‑147) | lysW/valZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > NC_000913/780623‑781213 | cccACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGCGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGttt > 1:459243/1‑300 (MQ=255) aaGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAc < 1:483636/300‑1 (MQ=255) aaGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGGAGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAc < 1:641041/300‑1 (MQ=255) gtagtaaaaaaggaagtagaacgtggtaTGAGAAACGGCCCCAAGGGATAAACGAAGTCGATGCATCCTGCACGACACACCACGGACATAATTAGTTGGGGTATCCCGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGGGCACCG‑CCCTTACAAGTAGAGGGTCGGCTGGTCGATCCCTACATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCg < 2:492930/273‑1 (MQ=14) 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aCGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑t < 1:754493/300‑1 (MQ=255) aCGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGACCCGAAGGGCTAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGTAGAGCACCT‑CCCTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑t < 1:51994/300‑1 (MQ=255) aatatacagaCGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCAAACTC‑AGAT‑GTTAAGCGTGAAGGA‑TAAc < 1:126160/291‑1 (MQ=255) 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ggATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTCACA‑TCGAAGCC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGttt > 2:377820/1‑299 (MQ=255) aCGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCAAACTC‑AGAT‑GTTAAGCGTGAAGGA‑TAAcctgtctctt > 2:125702/1‑291 (MQ=255) gtgtGAGCAACGGCCCGAAGTGCGAGACTAAGTCGAGTCATCCTGCACAACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGAGTAGTGTCTGGTGATTAGCTCAGCTGGTAGAACACTG‑CCCCTACGATGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAAc < 1:686286/297‑1 (MQ=18) 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2:345076/275‑1 (MQ=9) aGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATATTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCAc < 1:587571/300‑1 (MQ=255) aGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGTAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCAc < 1:205683/300‑1 (MQ=255) aGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGNTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCAc < 1:556121/300‑1 (MQ=255) aGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCAc < 1:362459/300‑1 (MQ=255) cATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGAc < 1:76893/300‑1 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1:584506/300‑1 (MQ=255) gACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAAG‑TCGGAGGC‑AGAG‑GTGAAGCGTTTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:588733/300‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGGAG‑CGAGTCATCATGCACGACCCACAACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCCGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGt > 2:493511/1‑300 (MQ=255) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCg > 1:280533/1‑300 (MQ=255) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGATCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCg > 1:751609/1‑300 (MQ=255) cTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAC‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCGTCCTGCACGAACCAACACTAGTGACGGTGGGTTCGGTGGAAGGAGTTTGTAGTATTCAGCGGCGTATAGGGTGATTAGCGCAGCTGGGAGAGCACCTCCATTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCGCTCGGGTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAATTTTACTCAATTGGTCGCAGGTTCg > 2:322163/1‑300 (MQ=25) cGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCGCTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTTGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATcc < 1:416645/300‑1 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCCCTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCACTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAACAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTg > 1:66126/1‑300 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGAGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGTAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGCATCCTg > 2:299759/1‑300 (MQ=255) aCCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CAAAG‑CGAGCCCCCCTACACAAACCCCCCCTACTGGCGGTGGGTTCGGTGGAAGCCATCTGCAGTATCCAGCGTCGTATCGGGTGGTTCGCTCAGCTGGGAGAACACTTACCTTAAAGGGAGGGGGTTGGCGGTTCGATCCCTTTACCAACCCCCAATCGGGTCGTTAGGTTAGGTGGTAGGGTAGTTGGCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTg > 1:730977/1‑300 (MQ=255) caccaGTTTGAACA‑TCTAAAAC‑AAAT‑TTGAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGTGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAACACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCTTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAc < 2:159441/300‑1 (MQ=21) | CCCACCAATCGCTAAGGTGGAAGCGGTAGTAAAACGTGAAGGATAACGTTGCATGAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCT‑CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA‑TCGAAGAC‑AGAT‑GTTAAGCGTGTAGGA‑TAACGTTGCGTCA‑GCAACGGCCCGTAGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAC > NC_000913/780623‑781213 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |