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CTCATTCAAAAAACCTCCACAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCGATTGAATCTACAGTGGTTGTGTTTGGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAAGAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCTTAGTGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAAC < 2:513167/300‑1 CCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATNATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCNGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATT > 2:534715/1‑300 ACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATTGACAA > 2:114971/1‑300 ATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGctgtctcttatacacatctcgcgg < 1:352739/300‑25 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATTGACAAAAACGAGAGAAAAATCGAA > 2:68238/1‑300 TGCGTTGACCAATTGAATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATTGACAAAAACGAGAGAAAAATCGAATACC > 1:183111/1‑300 CCAATTGAATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAAATGTGGACAATCGAATTGACAAAAACGAGAGAAAAATCGAATACCCACCATTT > 2:292725/1‑300 AATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATTGACAAAAACGAGAGAAAAATCGAATACCCACCATTTTTAACGT > 1:322110/1‑300 AATCTACAGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGAACAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATTGACAAAAACGAGAGAAAAATCGAATACCCACCCTTTTTAACGT > 2:399529/1‑300 ACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1469567‑1469296‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caGTGGTTGTTTTTTGAGCGTGATATCGGCAGTGCTATAAAATACGTTAATATAATGACCAATAAATATTTTTATCATGAATGTTTTTTGCCCGTATTGTTCGGGTTAATTAATGTTACATATTCAGCGGGCTGATTTTCATTTTTGCTGAATAAAGTCAATTTTTGTCACATTTCATCGTAGGGCTTACTGTGAAACGATCCGGTAAGCCGTTGGTGACGGGCGTGACCATAACTGTGGACAATCGAATTGACAAAAACGAGAGAAAAATCGAATACCCACCATTTTTAACGT < NC_000913/1995730‑1995439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |