Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,647,428 | C→T | A377V (GCG→GTG) | gor → | glutathione reductase (NADPH) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,647,428 | 0 | C | T | 99.1% | 372.6 / NA | 105 | A377V (GCG→GTG) | gor | glutathione reductase (NADPH) |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AACGAAAAAGGCTATATCGTCGTCGATAAATATCAAAACACCAATATTGAAGGTATTTACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAGCTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGC > NC_000913/3647136‑3647717 | aaCGAAAAAGGCTATATCGTCGTCGATAAATATCAAAACACCAATATTGAAGGTATTTACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAGCTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGTGATGtat < 2:374911/300‑1 (MQ=255) 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gtgtATAAATCCTCTTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTAt > 1:799033/1‑300 (MQ=255) ctctTTCACCTTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAg < 1:236688/300‑1 (MQ=255) tctTTCACCGTGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGc < 1:512138/300‑1 (MQ=255) | AACGAAAAAGGCTATATCGTCGTCGATAAATATCAAAACACCAATATTGAAGGTATTTACGCGGTGGGCGATAACACGGGTGCAGTGGAGCTGACACCGGTGGCAGTTGCAGCGGGTCGCCGTCTCTCTGAACGCCTGTTTAATAACAAGCCGGATGAGCATCTGGATTACAGCAACATTCCGACCGTGGTCTTCAGCCATCCGCCGATTGGTACTGTTGGTTTAACGGAACCGCAGGCGCGCGAGCAGTATGGCGACGATCAGGTGAAAGTGTATAAATCCTCTTTCACCGCGATGTATACCGCCGTCACCACTCACCGCCAGCCGTGCCGCATGAAGCTGGTGTGCGTTGGATCGGAAGAGAAGATTGTCGGTATTCACGGCATTGGCTTTGGTATGGACGAAATGTTGCAGGGCTTCGCGGTGGCGCTGAAGATGGGGGCAACCAAAAAAGACTTCGACAATACCGTCGCCATTCACCCAACGGCGGCAGAAGAGTTCGTGACAATGCGTTAAATGTTAAAGGGCTAAGAGTAGTGTGCTCTTAGCCCTTAATTACGTTTCCGCTATCAGTTCAGAAGC > NC_000913/3647136‑3647717 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |