| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,300,894 | IS1 (+) +8 bp | intergenic (+347/‑281) | insH21 → / → oppA | IS5 family transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 109 (1.030) | 71/596 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1300894 = | 0 (0.000) | intergenic (+347/‑288) | insH21/oppA | IS5 family transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 82 (0.780) | 53/596 | 0.8 | 98.8% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1300901 | 1 (0.010) | intergenic (+354/‑281) | insH21/oppA | IS5 family transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACAGGGGAGACACAGTACGAATCGACATAAGGTGATCGTCTGAATCACCAGAATAAATAAAGTCGGTGATAGTAATACGTAACGATAAAGTAACCTGACAGCAGAAAGTCTCCGAGCCTGTGCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACAT > NC_000913/1300601‑1301192 | atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCAttt > 1:676376‑M2/98‑300 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgtgcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTtggg < 1:89963‑M2/206‑2 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattattaattccaatgcctttggtagaggaaagtgctacATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATNTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAANATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAGTCGCTTAACGATTTTGAAAAAGGTAGTGGAGAGTAAGAACCGCATTtggg > 2:561201‑M2/95‑299 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataaccctgggctggctgaagaataattgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACNGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTtggg < 2:207204‑M2/206‑2 (MQ=255) 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AAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACATGCTTAGCCAATCTCTATTTGATTGAATTGAAAGATGTTTGTTAAGGCATGGATGCAAGCTATAGATTCTGATACGGTCAATAAAAGAGAATTGCTTAACAATTTTGCAAAATGTATTGGCGAGTAAGAACCGCATTTGGTACTTTCCGGGCAACCGCCAGACGATTCTTTATTGGTAATGAGAATAATTAACAATTAAAGAGCGTCGCGAAAGAATAATGTGTCTCGACAGGGGAGACACAGTACGAATCGACATAAGGTGATCGTCTGAATCACCAGAATAAATAAAGTCGGTGATAGTAATACGTAACGATAAAGTAACCTGACAGCAGAAAGTCTCCGAGCCTGTGCAGGGTCCCAATCCGGGATTACACATGCTGGTTAATACCAGTAATTATAATGAGGGAGTCCAAAAAACAATGACCAACAT > NC_000913/1300601‑1301192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |