New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1287084 | 67 (0.630) | 6 (0.060) | 5/558 | 9.3 | 9.7% | noncoding (153/171 nt) | rttR | small RNA RttR |
? | NC_000913 | 1287557 = | 49 (0.500) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NC_000913/1286789‑1287379 | gcTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:317828/300‑1 (MQ=255) cAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTccac > 1:760827/1‑297 (MQ=255) atgctgactttggtcgggtcTTCTCATCCTTGCCTGCTGGGG‑CAGAGGATTTGAGTGTGGATTCGTTTGAGAATTCCGGTGCTTTGGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCGGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGTGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTTGTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTTGTTTG‑AGAGTTCATGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:427781/281‑1 (MQ=14) aGTCTAACCTTGGGCGAAGCGTCTCATCCTTCCCCGCGTGTG‑CAGAATATTTAATTGCGGATTAGTTTGAGAATTCCGGGGTTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTAAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCTTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGATGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:3316/300‑1 (MQ=17) aGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCAGCCTTCCCCGCTTGGT‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGTAGAATTTCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:133497/300‑1 (MQ=17) aGTCGAACCTTGGTCGAAGTTTCTTATCCTTCCCCGCTTGGT‑CAGAATATGTGATTGATGATTCGTGTTAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:804644/300‑1 (MQ=17) aGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:766189/300‑1 (MQ=255) gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGANGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGCTTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgcaccctct > 2:748010/1‑290 (MQ=255) gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTACGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACATTAGTCGCAGTTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAATGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcacccgcgcg > 1:64909/1‑290 (MQ=17) aacttgggTCGAAGCTTCTCATCCTTACACG‑TTGGGTCAGAATATTCGATTATGGATTCGTTTGAGAGTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 2:547972/294‑1 (MQ=17) aaCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAATTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgc < 1:435737/300‑1 (MQ=255) aCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgcg < 1:721206/300‑1 (MQ=255) cTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTCCGGGTCGTTGCCTACGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCAGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGAATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCtttgg > 1:841606/1‑297 (MQ=255) ttCTCATCCTTCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCggg > 1:46118/1‑300 (MQ=255) ttCCCCGCTTGGG‑CAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCCTCAGGTCGTTGCCt > 1:379719/1‑300 (MQ=255) tttaggaTTCCGGTGCTTTGGAAAGTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCt < 1:728360/294‑1 (MQ=255) ggtttcaatgatttgaggaaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGACTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGt < 2:842073/282‑1 (MQ=14) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTAGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGTTtct > 1:138664/1‑300 (MQ=255) ctcatgaaggcgATGTTGGTGGGTGAAGGATTACTCGGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTGGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATGCGATTGCGGATTCGTTGG‑AGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGTGTAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTtctc < 2:342452/289‑1 (MQ=14) gtGAAATTGATGTTGGTGAGGGAAGGACTACCCACCGCTGCGTGCTTCGCCCTTCGAGGCGTTGCCTGAGTCAACGCCCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACTTTGGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCATGGGCAGAATGTGTAATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATc < 1:538801/299‑1 (MQ=14) gAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCt < 1:322008/300‑1 (MQ=255) tggtagtgtgtgaagaatccctcctcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGTGTCGTTGCTTGCGGCGGCGCCCTCTCGTTGACGCTCGGGCCGAACTTTAGGTGGAGCTTCTCATCTTTCCCCGCATGGTCAGAGTATGTGATTGTTTATTCGCTTT‑AGGGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:325783/275‑1 (MQ=17) ggtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 1:507316/300‑1 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCCGCGCTGCGCGCTTAGCAATTCGGGTCTTTTCCTGCGGCCACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTAGAACCTTGGTAGAAGCTTCTAATACTTACCCGAATg > 1:829588/1‑300 (MQ=14) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAAACTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAatat > 1:819812/1‑300 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGATGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGTTTCTCATCCTTACACGCATGGGCAGGATATTTGATTGCGGATTCGTTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAGGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGTTTCGCCCCGCGGGTCATTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGGTGGCACTCGAGTCGAACCTTAGCCGAAGCTTCTCATCCttacaagcgggggaagagtcgcc > 2:457225/1‑279 (MQ=14) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCTCGCTACGTTCTTAGCCCCTCGTGTCGTTGCCTACGACAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGACCCGTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGAATGGGCAGGATAttt > 1:359154/1‑300 (MQ=17) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGAATGGGCAGAATAttt > 1:299152/1‑300 (MQ=255) gactACTCAGCGCTGCGCGCTTCTCCCTTCTGGTCGTTGCCTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACTTTAGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCATGNGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCGTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTa < 1:607238/297‑1 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGGAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGCTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTg > 1:91519/1‑300 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCACTGCGCGCTTCGCCCCTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCACCGAATGGGCAGAATATTTAATTg > 1:770919/1‑300 (MQ=255) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCATGGTCCAAATGTTCGCCTTCTGACCCACTTT‑CAAATTCAGAGACTTTTGACCATAACGGTGGTGGGAGAAGGATTACTCAACACTTCGCTCCCCGCCCTTCTAGCCGCTGCCCGCGACAACACTCTCCCTCTGGCGCCCTAATCGAACCTTAGTCTAAACTTCTCATCCTTCCACGCATGGGCAGAATATCTAAtta > 1:90332/1‑299 (MQ=2) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGTAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGCGTCGAACCTTGGTCGCAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCCAAATATTTAATTGCGGAt > 1:283672/1‑300 (MQ=255) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGATGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAACTGCGGAt > 1:343957/1‑300 (MQ=255) cgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGGATGGGCAGAACATTCCATTGCgaagtcggtgtg > 1:333353/1‑289 (MQ=14) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGTTGACGCTCGAGCCGAACCTTGGGCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGTAGGGGCAGAGTGTTGGATTGCGGAGTCGTTTG‑AGAGTTTGGGGACTTTGGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCNCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATANTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 2:618386/300‑1 (MQ=17) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCATGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa < 1:466219/300‑1 (MQ=255) ctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGaa > 1:243967/1‑300 (MQ=255) aGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGACCCTTc > 1:525134/1‑300 (MQ=255) aCCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACCCCACGCTGCGCGCTTAACCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGATGGCGCTCGAATCGACCCTTAGCCGAAGCTTCTAATCCCTCCCCGAATGGGGAGAATGTTTCCCTGCGGATTTGTTGGAAAANTCAGGGATTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGCTTCGACCCTTNGAAGTc > 2:709664/1‑300 (MQ=14) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |