Predicted mutation | ||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 100 (0.940) | 75/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 362204 = | 0 (0.000) | coding (976/1254 nt) | lacY | lactose permease |
GTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGAGATAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGAA > NC_000913/19510‑20092 | gtgATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGAGATAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGNTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCAGGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCaa > 2:758648/1‑300 (MQ=255) 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agtagtAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGc < 1:502331/300‑1 (MQ=34) gCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACGGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTAAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTAAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCCCCGaa > 2:322146/1‑300 (MQ=9) | GTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGAGATAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACCACGTCAAAGGGTGACAGCAGGCTCATAAGACGCCCCAGCGTCGCCATAGTGCGTTCACCGAA > NC_000913/19510‑20092 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |