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CGCACCCTCTCTTTCAGAATAGGTATTGTCATAGGTGTTAACAAGTACTTTAGACGGGTTGGAAGTTGTAAGTTGCTTGATGTGTTTCACTCATCAGACTTGGGGAACAAAGCACAATTTATTGAAAATTATCCCTATTATATGAAAGTTCAAACACTCATGCCGCATTGGCCAGAAAACAACGCGCACTTCGTCAGTAATTTGATTCGCCAGACACAGTCTGGCGAGTTCATTGTTACCTCGCTTAAACTTCCAGCCAGTTCATAATACCGTCTGCCGCCTTACGACCTTCGGCAATAG < 2:453181/300‑1 GCACCTTCCCTTGCAGAATCGGTATTGTCAGAGGTGTTAACAAGTAATTGAGACGGATTGTAAATGAGAAATTGCTTGATGTGCTTCACTCATCAGACTTGGTGAACAAAGCACAATTTATTGAAAATTATCCCTATTATAGGAAAGGTCAAACGCTCATGCCGCATTTGCCAGAAAACAACGCGCACTTCGTCAGTAATTTGATTCGCCAGACACAGTCTGGCGAATTCATTGTTACCTCGCTTAAACTTCCAGCCAGTTCATAATACCGTCTGCCGCCTTACGACCTTCGGCAATAGC > 1:356282/1‑300 CACCTTCCCTTGCAGAATCGGTATTGTCAGAGGTGTTAACAAGTAATTGAGACGGATTGTAAATGAGAAATTGCTTGATGTGCTTCACTCATCAGACTTGGTGAACAAAGCACAATTTATTGAAAATTATCCCTATTATAGGAAAGGTCAAACGCTCATGCCGCATTTGCCAGAAAACACCGCGCACTTCGTCAGTAATTTGATTCGCCAGACACAATCTGGCGAATTCACTGTTACCTCGCTTAAACTTCCAGCCAGTTCATACTACCGTCTGCCGCATTACGAACTTCGGCAATAGCG > 2:243887/1‑300 CATTTCGCATCATCAAGCGACAGTTCGGCTTCGTGAAAGCCAGATACAAGGGGTTGCTGAAAAACGATAACCAACTGGCGATGTTATTCACGCTGGCCAACCTGTTTCGGGCGGACCAAATGATACGTCAGTGGGAGAGATCTCACTAAAAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2289213‑2288919‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGCAGAATCGGTATTGTCAGAGGTGTTAACAAGTAATTGAGACGGATTGTAAATGAGAAATTGCTTGATGTGCTTCACTCATCAGACTTGGTGAACAAAGCACAATTTATTGAAAATTATCCCTATTATAGGAAAGGTCAAACGCTCATGCCGCATTTGCCAGAAAACAACGCGCACTTCGTCAGTAATTTGATTCGCCAGACACAGTCTGGCGAATTCATTGTTACCTCGCTTAAACTTCCAGCCAGTTCATAATACCGTCTGCCGCCTTACGACCTTCGGCAATAGCG < NC_000913/3360850‑3360559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |