Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,771,979 | 0 | G | T | 99.4% | 571.8 / NA | 158 | intergenic (‑235/‑302) | yibI/mtlA | DUF3302 domain‑containing protein YibI/mannitol‑specific PTS enzyme IICBA component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (72/85); total (72/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
CATAAAAAATCACCAGAAAGACGAAGATCAGCACTCCCAACGCGAAATAGTTTAGAAACATATCTGCCTCGGATTCACGTTTATCAGTGTTGTTTTTGGGCTGGCAGCCAGAAGGGAGTCAGGCTGATATTTTGACAATAATCCGGGTTCGCGATTCTCGCCATAACACCAAAGAATAATTTTTAGAGGTGATGAGTTGCTTAGTTACATAACGATTGTATGACGAAGGCATAACATGCTGTAGATCACATCAGGTGAACGCCGTAAGAAAATATCTTGTGATTCAGATCACAAAGATTCAACAAACCATCAAAACAAAAATGTGACACTACTCACATTTAAATGCCATTTTTAGCGAAAATCGCCGCCTTGTTGCTTTTTTACACAAGCGTTTTGTGATGAACGTCACGTCAATTACCTCTCTACCCCCTATATTTATGTGATTGATATCACACAAAAGGCCGTCGACTGGACAGTTAACCGATTCAGTGCCAGATTTCGCAGTATCTACAAGGTCCGGCTACCTCTGCCGCCACATTAACAAAAAACCTCGGGCTTCCAGCCTGCGCGACAGCAAACATAAGAAGG > NC_000913/3771684‑3772271 | aaaaaaTCACCAGAAAGACGAAGATCAGCACTCCCAACGCGAAATAGTTTAGAAACATATCTGCCTCGGATTCACGTTTATCAGTGTTGTTTTTGGGCTGGCAGCCAGAAGGGAGTCAGGCTGATATTTTGACAATAATCCGGGTTCGCGATTCTCGCCATAACACCAAAGAATAATTTTTAGAGGTGATGAGTTGCTTAGTTACATAACGATTGTATGACGAAGGCATAACATGCTGTAGATCACATCAGGTGAACGCCGTAAGAAAATATCTTGTGATTCAGATCACAAATATTcaac < 1:98267/300‑1 (MQ=255) 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aTCACAAATATTCAACAAACCATCAAAACAAAAATGTGACACTACTCACATTTAAATGCCATTTTTAGCGAAAATCGCCGCCTTGTTGCTTTTTTACACAAGCGTTTTGTGATGAACGTCACGTCAATTACCTCTCTACCCCCTATATTTATGTGATTGATATCACACAAAAGGCCGTCGACTGGACAGTTAACCGATTCAGTGCCAGATTTCGCAGTATCTACAAGGTCCGGCTACCTCTGCGGCCACATTAACAAAAAACCTCGGGCTTCCAGCCTGCGCGACAGCAAACATaagaag < 2:243907/300‑1 (MQ=255) aTCACAAATATTCAACAAACCATCAAAACAAAAATGTGACACTACTCACATTTAAATGCCATTTTTAGCGAAAATCGCCGCCTTGTTGCTTTTTTACACAAGCGTTTTGTGATGAACGTCACGTCAATTACCTCTCTACCCCCTATATTTATGTGATTGATATCACACAAAAGGCCGTCGACTGGACAGTTAACCGATTCAGTGCCAGATTTCGCAGTATCTACAAGGTCCGGCTACCTCTGCCGCCACATTAACAAAAAACCTCGGGCTTCCAGCCTGCGCGACAGCAAACATaagaag < 1:119588/300‑1 (MQ=255) tCACAAATATTCAACAAACCATCAAAACAAAAATGTGACACTACTCACATTTAAATGCCATTTTTAGCGAAAATCGCCGCCTTGTTGCTTTTTTACACAAGCGTTTTGTGATGAACGTCACGTCAATTACCTCTCTACCCCCTATATTTATGTGATTGATATCACACAAAAGGCCGTCGACTGGACAGTTAACCGATTCAGTGCCAGATTTCGCAGTATCTACAAGGTCCGGCTACCTCTGCCGCCACATTAACAAAAAACCTCGGGCTTCCAGCCTGCGCGACAGCAAACATaagaaga > 2:159054/1‑299 (MQ=255) | CATAAAAAATCACCAGAAAGACGAAGATCAGCACTCCCAACGCGAAATAGTTTAGAAACATATCTGCCTCGGATTCACGTTTATCAGTGTTGTTTTTGGGCTGGCAGCCAGAAGGGAGTCAGGCTGATATTTTGACAATAATCCGGGTTCGCGATTCTCGCCATAACACCAAAGAATAATTTTTAGAGGTGATGAGTTGCTTAGTTACATAACGATTGTATGACGAAGGCATAACATGCTGTAGATCACATCAGGTGAACGCCGTAAGAAAATATCTTGTGATTCAGATCACAAAGATTCAACAAACCATCAAAACAAAAATGTGACACTACTCACATTTAAATGCCATTTTTAGCGAAAATCGCCGCCTTGTTGCTTTTTTACACAAGCGTTTTGTGATGAACGTCACGTCAATTACCTCTCTACCCCCTATATTTATGTGATTGATATCACACAAAAGGCCGTCGACTGGACAGTTAACCGATTCAGTGCCAGATTTCGCAGTATCTACAAGGTCCGGCTACCTCTGCCGCCACATTAACAAAAAACCTCGGGCTTCCAGCCTGCGCGACAGCAAACATAAGAAGG > NC_000913/3771684‑3772271 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |