| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,367,944 | G→A | A40T (GCG→ACG) | yhcG → | DUF1016 domain‑containing protein YhcG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,367,944 | 0 | G | A | 99.1% | 425.1 / NA | 115 | A40T (GCG→ACG) | yhcG | DUF1016 domain‑containing protein YhcG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (56/58); total (57/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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cGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCACGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAATGTCTGGCGAATTAACACCATTGGGAATTCCGCAGACACCGTCTGCAGAATTCCCATCGGCAAAGATTTGGCAGACg > 1:5069/1‑300 (MQ=255) gCGTTAACGCGTTAATGACCACGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAATGTCTGGCGAATTAACACCATTGGGAATTCCGCAGACACCGTCTGCAGAATTCCCATCGGCAAAGATTTGGCAGGCGCTGt > 1:282331/1‑300 (MQ=255) gCGTTAACGCGTTAATGACCACGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAATGTCTGGCGAATTAACACCATTGGGAATTCCGCAGACACCGTCTGCAGAATTCCCATCGGCAAAGATTTGGCAGACGCTGt > 1:190464/1‑300 (MQ=255) aaCGCGTTAATGACCACGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAATGTCTGGCGAATTAACACCATTGGGAATTCCGCAGACACCGTCTGCAGAATTCCCATCGGCAAAGATTTGGCAGACGCTGTCTGcc < 1:796171/300‑1 (MQ=255) gACCGCGACGTACCCGGAGATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGTGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCCCTTTTCAACATACTAAAATCCAACAACCAATGTCTGCCAAATTAACACTACTGGGAATTCCGCAGACCCCGCCTGCAGAATTCCAATCGGCAAGGATGTGGCAGACGTTGCCGGCCAAATCtttaca > 2:248510/1‑297 (MQ=255) gACCACGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAATGTCTGGCGAATTAACACCATTGGGAATTCCGCAGACACCGTCTGCAGAATTCCCATCGGCAAAGATTTGGCAGACGCTGTCTGCCAAATCTTTccc > 1:830896/1‑300 (MQ=255) | TGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTCACCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGACGGAAACGGTACGTAGCGTTAACGCGTTAATGACCGCGACGTACCAGGAAATTGGCCGACGAATTGTCGAATTTGAACAAGGTGGCGAGGCCAGGGCTGCGTATGGTGCGCAGCTAATCAAGCGACTATCAAAGGATTTATGTCTAAGGTATAAGCGTGGGTTCTCTGCAAAAAACTTACGCCAAATGAGGCTTTTTTACCTCTTTTTTCAACATGTTGAAATTCACCAGACAATGTCTGGCGAATTAACACCATTGGGAATTCCGCAGACACCGTCTGCAGAATTCCCATCGGCAAAGATTTGGCAGACGCTGTCTGCCAAATCTTTCCC > NC_000913/3367649‑3368239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |