| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,748,396 | G→A | A145A (GCG→GCA) | ypjD → | cytochrome c assembly family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,748,396 | 0 | G | A | 99.2% | 430.0 / NA | 118 | A145A (GCG→GCA) | ypjD | cytochrome c assembly family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (66/51); total (66/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.41e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCTGGCGCTGGCAACCTTCATGCCCAATGAATACATCACCCATCTGGAAGCTACGCCTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTACGCGCTGCAACTGGCGTGGATTGATTACCAACTGAAGAACAAGAAGCTGGCGTTTAACCAGGAAATGCCGCCATTGATGAGTATCGAGCGTAAAATGTTCCACATCACGCAGATTGGCGTGGTGCTGCTAACGCTCACGCTTTGCACTGGCCTGTTCTACATGCACAACTTATTTAGCATGGAAAATATCGACAAGGCTGTGCTCTCTATCGTGGCGTGGTTTGTCTATATTGTGCTGCTGTGGGGACATTATCATGAAGGATGGCGTGGACGCCGCGTCGTCTGGTTTAACGTTGC > NC_000913/2748100‑2748689 | aTCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCTGGNGCTGGCAACCTTCATGCCCAATGAATACATCACCCATCTGGAAGCTACGCCTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGNCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTACGCACTg < 2:607949/300‑1 (MQ=255) 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ATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTACGGTAATGACCATTGTGGCTTCTCGCAATCGTGGCTGGCTGCTGCTACCCATTGTCTATGCCTTTGCGCTTATCAACCTGGCGCTGGCAACCTTCATGCCCAATGAATACATCACCCATCTGGAAGCTACGCCTGGGATGCTGGTGCACATTGGCTTATCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTACGCGCTGCAACTGGCGTGGATTGATTACCAACTGAAGAACAAGAAGCTGGCGTTTAACCAGGAAATGCCGCCATTGATGAGTATCGAGCGTAAAATGTTCCACATCACGCAGATTGGCGTGGTGCTGCTAACGCTCACGCTTTGCACTGGCCTGTTCTACATGCACAACTTATTTAGCATGGAAAATATCGACAAGGCTGTGCTCTCTATCGTGGCGTGGTTTGTCTATATTGTGCTGCTGTGGGGACATTATCATGAAGGATGGCGTGGACGCCGCGTCGTCTGGTTTAACGTTGC > NC_000913/2748100‑2748689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |