| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 33 (0.310) | 31/598 | 2.4 | 24.4% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3128122 | 102 (0.960) | intergenic (‑101/‑150) | glcD/glcC | glycolate dehydrogenase, putative FAD‑linked subunit/DNA‑binding transcriptional dual regulator GlcC | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TTCCATTTGCTTAGGCAGAACAACCAGTAATGGACGCGTGCGATACGCGCTCAACCCGTCACACTCGTAAGGAATGATCTCCTCATCGGTATGCAGGATCTCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAA > NC_000913/3127824‑3128421 | ttCCATTTGCTTAGGCAGAACAACCATTAATGGACGCGTGCGATACGCGCTCAACCCGTCACACTCGTAAGGAATGATAGAATCATCGGTATGCAGGATCTCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGc < 1:651810/300‑1 (MQ=255) 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tGCTTAGGCAGAACAACCAGTAATGGACGCGTGCGATACGCGCTCAACCCGTCACACTCGTAAGGAATGATCTCCTCATCGGTATGCAGGATCTCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGCTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGggaaggtg < 2:343244‑M2/300‑9 (MQ=255) tGCTTAGGCAGAACAACCAGTAATGGACGCGTGCGATACGCGCTCAACCCGTCAAACTCGTAAGGAATGATCTCCTCATCGGTATGCAGGATCTAAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGCCCAGTTATTACGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACTGGt > 2:243058/1‑300 (MQ=255) aGGCAGAACAACCAGTAATGGACGCGTGCGATACGCGCTCAACCCGTCACACTCGTAAGGAATGATCTCCTCATCGGTATGCAGGATCTCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGAc > 1:778649/1‑300 (MQ=255) 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cttccttAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCAc < 1:38897/295‑1 (MQ=255) ctctTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACt > 1:533605/1‑300 (MQ=255) ctctTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGAACTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATCATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGAATGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACt > 1:197312/1‑300 (MQ=255) | TTCCATTTGCTTAGGCAGAACAACCAGTAATGGACGCGTGCGATACGCGCTCAACCCGTCACACTCGTAAGGAATGATCTCCTCATCGGTATGCAGGATCTCAAGTCCAGGGACATGCTCACGCAGTGCCATCAGTACCGATGTGCGGTCGACATCGGGTAAAGCGCCATCAAGACGCTCTTCGTACAAGATGCTCATGAGTAGGCTTCGCTTTGTTGTGTTGTGTGGCAGCTGATTTTTGCGCGCTGCTTCTGTGAACAGTTATTAAGCGGGCTTTTCGTTTTCGTCTATCTCTTTAGCTACCGGTCAGACCATTTTTTTTCCAGCTCTGTGACCTTGTCTTGGTTAACTCAATGTTAAATTGATGTAACATAATCACTTACGTGATGTGCGTGTTTTGCGAGTTAAGAACAGAAAAATTGGTCCTACCTGTGCACGAGGTCCGGGAATGAAAGATGAACGTCGCCCTATTTGCGAAGTGGTTGCAGAGAGTATCGAACGGTTAATTATCGACGGCGTACTGAAGGTCGGTCAGCCGCTTCCCTCGGAACGTCGACTGTGTGAAAAGCTCGGCTTCTCACGCTCCGCACTGCGTGAA > NC_000913/3127824‑3128421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |