Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,501,192 | C→T | P207L (CCT→CTT) | tehA → | tellurite resistance protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,501,192 | 0 | C | T | 98.8% | 316.6 / NA | 86 | P207L (CCT→CTT) | tehA | tellurite resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (49/36); total (49/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCAGTTTTGGTGTCGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCCTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCTTTTCGGTTATGGACTGCTGCAACTGCTGTTTATGCTACGTCTGATGCCATGGTATCTCTCCCAGCCATTTAATGCTTCATTCTGGAGTTTCTCGTTCGGCGTATCTGCACTGGCAACCACCGGTTTGCATCTGGGGAGTGGCAGCGATAATGGATTTTTCCATACGCTGGCGGTGCCGCTGTTTATCTTTACCAATTTTATTATTGCAATACTGC > NC_000913/1500898‑1501476 | tCAGTTTTGGTGTCGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTgcgc < 1:240389/300‑1 (MQ=255) tCAGTTNTGGTGTCGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATNATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTgcgc < 2:648454/300‑1 (MQ=255) cGTGGTTCAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAg < 1:317135/300‑1 (MQ=255) cAGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATTAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGTTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTgg > 2:281340/1‑300 (MQ=255) aGTTGGCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCGACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGc < 2:457296/300‑1 (MQ=255) ggCTTATGCCGCCTGGCAAACTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAg > 2:45972/1‑300 (MQ=255) cTGCGGGATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTg < 2:426465/300‑1 (MQ=255) gggATTATGGCGCGGATCTCACCCGGAAGAAACTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTGGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCATTTCTGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGacac < 2:786756/300‑1 (MQ=255) ggATTATGGCGCGGATCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCATGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACg > 2:612527/1‑300 (MQ=255) aTCTCACCCTGAAGAAGCTACCACGCCTGGACTGTATCTGCCGACAGTTGCCAACAACTTTATCAGCGCAATGGCCTGTGGTGCGTTGGGCTACACCGACGCCGGTCTGGTGTTTTTAGGCGCAGGCGTTTTCTCATGGCTAAGCCTTGAACCGGTGATCTTGCAGCGTCTGCGCAGTTCGGGAGAATTACCCACGGCACTGCGGACATCACTCGGCATTCAGCTCGCTCTTGCGCTGGTGGCTTGTAGTGCCTGGCTGAGCGTCAACGGCGGCGAGGGTGACACGCTGGCGAAAATGCt > 1:39353/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |