Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,315,384 | G→A | Y129Y (TAC→TAT) | yciF ← | DUF892 domain‑containing protein YciF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,315,384 | 0 | G | A | 99.2% | 480.1 / NA | 132 | Y129Y (TAC→TAT) | yciF | DUF892 domain‑containing protein YciF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (59/72); minor base C (1/0); total (60/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
ATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGGTAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTGCG > NC_000913/1315090‑1315678 | aTGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGCTAAcc > 2:67728/1‑300 (MQ=255) 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gctTTACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCtt > 1:504660/1‑300 (MQ=255) gctTTACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTGTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCtt > 2:754318/1‑300 (MQ=255) ttACGATAACCGAATTGTTCAGCCATCTTCGCTAGTGTCCCGTAACTTTCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAATACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGAGGTTGCTCTTGCg < 2:379111/300‑1 (MQ=255) | ATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGGTAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTGCG > NC_000913/1315090‑1315678 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |