Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,279,461 | A→G | H183R (CAT→CGT) | kbaZ → | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,279,461 | 0 | A | G | 99.0% | 378.4 / NA | 101 | H183R (CAT→CGT) | kbaZ | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 1 chaperone |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (49/51); minor base T (0/1); total (49/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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gTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTgc > 1:237975/1‑300 (MQ=255) gTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCACGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTg > 1:154398/1‑300 (MQ=255) tGCCGGTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTgg > 1:351838/1‑300 (MQ=255) ggTACCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTGGTGAt < 1:208431/300‑1 (MQ=255) aCCTGGCGGCGCGCGTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTGGTGATTGa > 1:624184/1‑300 (MQ=255) cgcgcgTGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTGAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTGGTGATTGACCACTTTGc < 2:166041/300‑1 (MQ=255) | ATTCTGGGTGGTGACCATCTGGGGCCAAACCGCTGGCAAAACCTGCCGGCCGCTCAGGCAATGGCCAATGCCGATGATTTGATTAAAAGCTACGTTGCGGCAGGATTCAAAAAAATCCACCTTGATTGCAGCATGTCCTGTCAGGACGATCCGATTCCCTTAACTGATGACATCGTGGCTGAACGCGCCGCCCGTCTGGCGAAAGTGGCGGAAGAAACCTGTCTTGAACACTTTGGCGAAGCCGATCTGGAGTATGTCATTGGTACCGAAGTGCCGGTACCTGGCGGCGCGCATGAAACCTTAAGCGAGCTGGCGGTCACCACGCCGGATGCCGCCCGCGCCACGCTGGAAGCCCATCGTCACGCCTTTGAAAAGCAAGGTTTGAATGCCATCTGGCCACGCATCATTGCCCTGGTGGTTCAACCCGGCGTCGAATTCGATCACACCAACGTTATTGATTATCAGCCCGCCAAAGCGAGCGCCTTAAGCCAGATGGTCGAAAACTACGAAACGCTGATTTTCGAAGCGCACTCTACCGATTATCAAACGCCGCAATCGCTGCGCCAGCTGGTGATTGACCACTTTGC > NC_000913/3279169‑3279755 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |