Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,105,586 | G→T | intergenic (+74/‑128) | mltC → / → nupG | membrane‑bound lytic murein transglycosylase C/nucleoside:H(+) symporter NupG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,105,586 | 0 | G | T | 99.2% | 442.8 / NA | 124 | intergenic (+74/‑128) | mltC/nupG | membrane‑bound lytic murein transglycosylase C/nucleoside:H(+) symporter NupG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (60/63); total (60/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ACCCAACATCGCGGCGTTATGCCGTCATCACCGCCTATAACGGCGGCGCAGGCAGCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCCGCATCACGATGTGAGGAAATTAACATGAATCTTAAGCTGCAGCTGAAAATCCTCTCTTTTCTGCAGTTCTGTCTGTGGGGAAGTTGGCTGACGACCCTCGGCTCCTATATGTTTGTTACCCTGAAGTTTGACGGTGCTTCTATTGGCGCAGTTTATAGCTCACTGGGTATCGCAGCGGTCTTTATGCCTGCG > NC_000913/3105292‑3105881 | aCCCAACATCGCGGCGTTATGCCGTCATCACCGCCTATAACGGCGGCGCAGGCAGCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTCACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAANACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGTAATGt > 1:583985/1‑300 (MQ=255) 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ACCCAACATCGCGGCGTTATGCCGTCATCACCGCCTATAACGGCGGCGCAGGCAGCGTGCTGCGAGTCTTTTCGAATGATAAGATTCAGGCTGCCAATATTATTAACACCATGACGCCGGGCGATGTTTATCAGACGCTGACGACCCGCCATCCCTCTGCGGAATCTCGCCGTTATCTTTATAAAGTGAATACCGCGCAAAAATCCTACCGCCGCCGATAATTCCATTAACCGCCCCTGACGATGCTCAGGGGCAAAAATGTTATCCACATCACAATTTCGTTTTGCAAATTGGGAATGTTTGCAATTATTTGCCACAGGTAACAAAAAACCAGTCCGCGAAGTTGATAGAATCCCATCATCTCGCACGGTCAAATGTGCTTTTTCAAACACTCATCCGCATCACGATGTGAGGAAATTAACATGAATCTTAAGCTGCAGCTGAAAATCCTCTCTTTTCTGCAGTTCTGTCTGTGGGGAAGTTGGCTGACGACCCTCGGCTCCTATATGTTTGTTACCCTGAAGTTTGACGGTGCTTCTATTGGCGCAGTTTATAGCTCACTGGGTATCGCAGCGGTCTTTATGCCTGCG > NC_000913/3105292‑3105881 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |