| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,626,183 | (GCG)3→2 | coding (272‑274/1383 nt) | radA → | DNA recombination protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4626179 = | 1 (0.010) | 89 (0.910) | 63/584 | 0.3 | 99.5% | coding (268/1383 nt) | radA | DNA recombination protein |
| ? | NC_000913 | = 4626175 | 0 (0.000) | coding (264/1383 nt) | radA | DNA recombination protein | |||||
GCGGGCGGCACAGCATTAACGAGGTACACCGTGGCAAAAGCTCCAAAACGCGCCTTTGTTTGTAATGAATGCGGGGCCGATTATCCGCGCTGGCAGGGGCAGTGCAGTGCCTGTCATGCCTGGAACACCATCACCGAGGTGCGTCTTGCTGCGTCGCCAATGGTGGCGCGTAACGAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGCCTTGAAGAGCTGCCGCGTTTTTCCACCGGATTTAAAGAGTTCGACCGCGTACTAGGCGGCGGCGTGGTGCCAGGAAGTGCCATTCTGATTGGCGGTAACCCTGGTGCGGGGAAATCCACGCTGCTACTGCAAACGCTGTGCAAACTGGCCCAGCAGATGAAAACGCTGTATGTCACCGGCGAAGAGTCGCTGCAACAGGTGGCAATGCGCGCTCATCGCCTTGGCCTGCCGACTGACAATCTCAATATGTTGTCGGAAACCAGCATCGAACAGATCTGCCTGATTGCCGAAGAAGAGCAACCGAAGCTGATGGTAATTGACTCGATCCAGGTGATGCATATGGCGGATGTACAG > NC_000913/4625882‑4626475 | gcgggcggCACAGCATTAACGAGGTACACCGTGGCAAAAGCTCCAAAACGCGCCTTTGTTTGTAATGAATGCGGGGCCGATTATCCGCGCTGGCAGGGGCAGTGCAGTGCCTGTCATGCCTGGAACACCATCACCGAGGTGCGTCTTGCTGCGTCGCCAATGGTGGCGCGTAACGAGCGTCTCAGCGGCTATGCCGGTAGCGCCGGGGTGGCAAAAGTCCAGAAACTCTCCGATATCAGCCTTGAAGAGCTGCCGCGTTTTTCCACCGGATTTAAAGAGTTCGACCGCGTACTAggcggc > 1:449865/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |