| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4392437 | 66 (0.660) | 4 (0.050) | 4/442 | 7.8 | 5.9% | intergenic (+2/‑35) | glyV/glyX | tRNA‑Gly/tRNA‑Gly |
| ? | NC_000913 | 4392661 = | 78 (1.060) | intergenic (+3/‑231) | glyY/yjeV | tRNA‑Gly/uncharacterized protein YjeV | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCG‑CTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTA > NC_000913/4392156‑4392736 | tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 1:68517/300‑1 (MQ=255)tCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCaa < 2:481648/300‑1 (MQ=255) ggTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTAGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCaaagtcttaccaccgtaacatatcc > 2:152287/1‑278 (MQ=255) ggTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATGGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTGGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGcac < 1:708591/300‑1 (MQ=255) gTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGCGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGcac < 2:502898/300‑1 (MQ=255) gTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTAGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGcac > 2:49648/1‑300 (MQ=255) gTAAGCGCTGGAATTCACTTGCTGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTTAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTGGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTNTAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAATGCTGCAAAGCACAGacc < 2:197789/300‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCTTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 1:105491/300‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCGTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGAGAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGGTGCAGAGGGAAAGATGTCTAGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTTAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 2:107296/300‑1 (MQ=255) gTAAGCACCGGAATCCACTTGCGGCGGCTTGATGTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGacc < 2:228735/300‑1 (MQ=255) 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ggAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCg < 1:258307/300‑1 (MQ=255) ccACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTTAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAAt < 1:310935/300‑1 (MQ=255) ccACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACGTTAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGGTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAAt < 2:414741/300‑1 (MQ=255) 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TCCTGGTCACGTAAGCGCCGGAATCCACTTGCGGCGGCGTGATTTTGACGCTAAATTGAACGTCTTGCTGATAATTTCAGCACTTGAGATAAAAACGCAAAAAAAACTTTTTTGGGGGGTTGCAGAGGGAAAGATTTCTCGTATAATGCGCCTCCCGTAACGACGCAGAAATGCGAAAATTACGAAAGCAAAATTAAGTAGTACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA‑CCTTGCCAAGGTCGGGGTCGC‑GAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCG‑CTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTA > NC_000913/4392156‑4392736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |