| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1481216 | 66 (0.660) | 68 (0.680) | 58/598 | 0.5 | 50.7% | coding (308/1293 nt) | ynbD | phosphatase domain‑containing protein YnbD |
| ? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CGCTGGCTGGTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGA > NC_000913/1480920‑1481515 | ggTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGggaaggtgcga > 2:761136‑M1/1‑289 (MQ=255) ggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaacacggctcgatgacttccaacatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggaaaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctacagatgacaaacatgatctcatatcagggacctgttcgcaccttcaTTAGTTTTATCCGTCCTg < 2:32999‑M1/18‑1 (MQ=255) tgttgCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGTATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAag < 1:285859/300‑1 (MQ=255) tgttgCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAag < 1:148923/300‑1 (MQ=255) gtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAagt < 1:759464‑M1/22‑1 (MQ=255) cTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCACTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAagtgagt < 1:588469/300‑1 (MQ=255) gctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTgggg < 2:607839‑M1/30‑1 (MQ=255) gcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccanccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatnagggacttgttcgcaccttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGa < 2:749106‑M1/33‑1 (MQ=255) gcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGa < 2:517285‑M1/33‑1 (MQ=255) atgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACg < 1:109683‑M1/35‑1 (MQ=255) 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gAAGTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcatatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatgatgcga > 1:276847‑M1/1‑9 (MQ=255) ttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGNCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGNTGGAAt < 2:652918‑M1/296‑1 (MQ=255) gtttTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCAAAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGa > 2:428558/1‑300 (MQ=255) | CGCTGGCTGGTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATTATCAGA > NC_000913/1480920‑1481515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |