| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1481213 = | 66 (0.660) | 60 (0.600) | 45/598 | 1.1 | 47.6% | coding (305/1293 nt) | ynbD | phosphatase domain‑containing protein YnbD |
| ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
ACAAGGCGCTGGCTGGTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATT > NC_000913/1480914‑1481509 | aCAAGGCGCTGGCTGGTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAagtt > 1:377518/1‑300 (MQ=255) gccatcgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGttt > 2:406451‑M1/294‑300 (MQ=255) cgcTGGCTGGTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGgga < 1:414687‑M1/300‑4 (MQ=255) cgctcaggttgtaccaatgctgcatgcagtgaatgcgtagcatggtttccagcggataaggtcgccggccattaccagccttttggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagacgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGTTTTATcc > 2:355279‑M1/289‑300 (MQ=255) ggTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGggaaggtgcga > 2:761136‑M1/1‑289 (MQ=255) tATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGggaaggtgcgaata < 1:379349‑M1/300‑15 (MQ=255) ttgttgCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGaa > 1:758873/1‑300 (MQ=255) 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gCTCTATCCGCTGAAGTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacntatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgc > 1:530138‑M1/1‑21 (MQ=255) cttgttcgcaccttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGAc < 2:459007‑M1/284‑1 (MQ=255) gAAGTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcatatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatgatgcga > 1:276847‑M1/1‑9 (MQ=255) gAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGaa < 1:441460/300‑1 (MQ=255) ttccTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGNCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGNTGGAAt < 2:652918‑M1/296‑1 (MQ=255) aGTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatccccagtttttagtgagatctctcccactgacgtatcatttggtccgcccgaaacaggttggccagcgtgaataacatcgccagttggttatcgtttttcagcaaccccttgtatctggctttcacgaagccgaactgtcgcttgatgatgcgaaa > 1:484048‑M1/1‑7 (MQ=255) | ACAAGGCGCTGGCTGGTTATTGTTGCTGGCCCCGTTTTTCTTCTTCACCTATGGATCTCTTAATCAGTTCACCGCGGTTCAGGACCTTAACAGCCATGATATCCCCAGTCAGGTATTCGGTTGGGAAACGGCGATCCCTTTTCTTCCCTGGACTATTGTTCCTTACTGGAGTCTGGATCTTTTATATGGATTTTCGCTGTTCGTTTGTAGCACGACATTCGAACAGCGCCGACTTGTCCACCGGCTTATTCTGGCAACGGTAATGGCCTGCTGCGGTTTTTTGCTCTATCCGCTGAAGTTTAGTTTTATCCGTCCTGAAGTGAGTGGGGTGACGGGATGGCTATTTTCGCAACTTGAACTGTTTGATCTGCCTTATAACCAGTCTCCTTCGCTGCATATTATTCTCTGCTGGCTACTTTGGCGTCACTTTCGTCAGCATCTGGCTGAGAGGTGGCGTAAAGTCTGCGGCGGATGGTTTTTACTCATCGCCATTTCGACGCTGACGACCTGGCAGCATCATTTTATTGATGTCATCACAGGGCTGGCGGTAGGTATGTTGATTGACTGGATGGTGCCCGTCGACCGTCGTTGGAATT > NC_000913/1480914‑1481509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |