| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696741 | 72 (0.720) | 6 (0.080) | 6/442 | 6.7 | 9.7% | intergenic (‑1/+15) | metU/glnW | tRNA‑Met/tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 697135 = | 58 (0.790) | intergenic (‑2/+378) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAATTTCGCCA > NC_000913/696453‑697040 | ccTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGTAATTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACATAGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACTGCTTGGCGATACCCCAACAAGTTGGTTTTGAATTTGCCGCACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGGCGGGATTCGAACCCGTGACCTCATCATTCTGGGTGATGTGC‑CCTAAACAACTGAGCTACGTAGCCAGCTTGTttctc > 2:256770/1‑299 (MQ=255) aTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTAc > 1:668654/1‑300 (MQ=255) tCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGGGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 2:492204/300‑1 (MQ=255) tgcatgaCCGCTTGGCGATACCACAATGGGGGGCATTGACACGGTGAGCTGCGTGAATAAGTGGGCTGGAGTACGAGGATTCGAACCTCTGAATGCCGGAATCAGAATCCTGTGCCTTACCGCTTGTCGATACCCCGACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAc < 2:4340/294‑1 (MQ=37) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACGGGATGCACTTACAAGGTAAGCGGCGTGAATCAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGAGACCCCAACAAATTGGGTTTGAATTTGCCGAACATAGTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGAGTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTTAGCTACGTAGCCAGATTGTCTCTTCGATGGCTGGGGTGCCTGGATTCGAAcc < 2:421105/300‑1 (MQ=38) gccGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACGATGTAAGCGTCGTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAAGGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAAGTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGATTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGa < 2:249950/299‑1 (MQ=255) aCCGCTTGGCGATACCCCACCGGTGTGCACTGACAAGGTACGCGTCTCGAATAACTTGTCTGTGGTACTACAATTCGAACCGCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCGTGGCGAGACCCCAATAAATTGGTGTTGAGGTGGCCGAATATAGTAGATGCATTCAGAATTTGGTTGCTACGACATGATTCGAACCTGCGACCCCGTCATTATGAGTGATATGC‑TCTAAAAAACTGAGCGACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGAGGTACCTGGATTCAAACCAGGGa < 2:417699/300‑1 (MQ=255) gCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCATCTTTTTTCTTCGATGGCTgtagtaactttattcgacacatggcatg > 1:513991/1‑273 (MQ=38) gCTTGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAACTGGCTTTGAATTTGCCAGACGTAGTCGATACATTCAGTACTTGGCGGCTACGACGGGACTCACACCCTCGACCCCCTCTTTCTTAGTGATGTGC‑TCTACCCCACTTAGCTANGTAGCCCTCTTGTTTCTTCAGTGGCTggagcatctaacttcgacaccntgcata > 2:662149/1‑274 (MQ=16) ttGGCGATACCCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGcc < 1:491530/300‑1 (MQ=255) cccaaaCTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAAACTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGAGTCGAAAAAGGGAGTGTCGGTAGCaaa > 2:32434/5‑300 (MQ=39) ggTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGc > 1:454588/1‑300 (MQ=255) gaggCGTCTTGAATAAATTTGTTTGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGGATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGa < 2:462636/297‑1 (MQ=255) gTCTTGAATAAATTGGCTTGGATACGAGGATTCGAACCGCGGAATGCCGGAATCNGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGNTTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 2:747511/300‑1 (MQ=255) gtAAATTGTCTGGGGTACGATGATTCGAACCTCGGAACGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTATCGCTTGGCGATACCCCAATAAATTGGGTTTGAATTGGCCGANCATAGGCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTGCGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCACTATGAGTGATGTGC‑GCGAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGACGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAc < 2:704549/299‑1 (MQ=38) aTAAATTGGCTGGGGTACTAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAc < 1:150765/300‑1 (MQ=255) aTAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAc < 1:96967/300‑1 (MQ=255) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGCATGCCGGTATCACAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCACTCACCGGGCGGTGAAc > 1:328806/1‑300 (MQ=255) gggTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGACACCCCAACAAATTGTTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCNCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACNAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAAc < 2:534546/300‑1 (MQ=255) 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aTCAGAATCCGGTGCCTTGCTGCTTGGCGATACCCCAATAAATTGGTTTGGAATTTGCCGAACATATGCGATACATTCAGAATTTGGTTGCTACGACGGGAGTCGCACCGGCGACCCCATCATTATGAGTGACGTGC‑TCTAACCAACCGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGGTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTg < 2:267296/300‑1 (MQ=38) caaaattcggcgcctcgccGCTTGGCGATACACCAACAAAGTGGTTTTGAATTTTCCAAACATATTCGATGCATTCAGAATTTGGTTGCTACGACGGGAGTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAGCTGAGCTACGTAGCTAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTTGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCCTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGa < 2:150290/283‑1 (MQ=38) gAATCCGGTGCCTTACCGCTTTTCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTGCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 2:711908/300‑1 (MQ=255) gAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTGGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTAGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGAtt < 2:368976/300‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTGGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCNTCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAc < 1:538706/300‑1 (MQ=255) gCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCNATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAACAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGNGCGGTGAACCGCTTAATCGAAGAAGATGGATGGGGTACCTGGATTCGAACCAgg > 2:748937/1‑300 (MQ=255) 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cccATCATTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCAGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCacac < 1:642635/300‑1 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCtt > 1:136188/1‑300 (MQ=255) atcatTATGAGTGATGTGC‑TCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAAACAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCtt > 1:136725/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |