| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1287329 | 76 (0.680) | 8 (0.100) | 7/424 | 6.9 | 13.1% | intergenic (‑1/+209) | tyrV/tyrT | tRNA‑Tyr/tRNA‑Tyr |
| ? | NC_000913 | 1287624 = | 52 (0.650) | intergenic (‑2/+158) | tyrT/purU | tRNA‑Tyr/formyltetrahydrofolate deformylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAC > NC_000913/1287034‑1287624 | tCGCTTGAGAGTTTGGGGATTTTTGAAAGTGATGGTGTTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGGCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAgggg < 1:23799/300‑1 (MQ=21)gcgtcgcagggttcgggtatttgcggaagcgATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAtggg < 2:31411/270‑1 (MQ=21) gagaGTTTCGGGACTTTTGAAAGCGGTGGGGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCACTGCGCGCTGCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGTGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTc < 2:527430/300‑1 (MQ=21) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGTTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGCTGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAAGGCAGATCTACA‑GTCTGCTCCCTCTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAAGGGTGATTCagct > 2:470542/1‑297 (MQ=21) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCAACAGGGGGAATTcccat > 2:154296/1‑296 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGc < 1:98084/300‑1 (MQ=255) aaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCACTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGATGGCGCCCGCGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGGAGGGTGTTTAATTGTGGATTAGTGGGGAAGTTCANGGATTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGCACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCAGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTGGTTCAAATTTGGCGGTAATgttta > 2:212585/1‑296 (MQ=21) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCACACCCTCGAAGTCCCTGGCGCCAGATTT‑CACGTCCGCCCCCTCTGGCCTCTCGGGAAC‑CCCAACAAAGGTAATTCACCTTTTGAGGTAATGCT‑TGAGCtggtg > 1:232302/1‑300 (MQ=17) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGAtggtg > 1:301171/1‑300 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTACACGCGTGGGCAGAGTGTTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGCAGGATTCGACCCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAACTCACCTTTTGAGGTACGGCT‑Tgatgtggtg > 2:440153/1‑293 (MQ=21) ggggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTAATTGCGGATTCGTTGGGAANTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGNTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTgggg < 2:598904/300‑1 (MQ=255) ggggAAGGATTACTCAGCGCTACGCACTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCCCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGGAGTTCAGGGACTTTGGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTgggg < 2:47942/300‑1 (MQ=255) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTggggg > 1:244204/1‑300 (MQ=255) gAAGGATTACTCAGCGCGTCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCTGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGTTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGaa < 2:105617/300‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGATCGAGTCAGACCTGGGTCGAAGCTTATAATCTTTCCATGCATGGGCAGAATATGTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGCCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCCGCTCCCTTTGGCAGCTCGGGAAC‑CCCACTAAAGGTCATTCAAATTTTGAGGCAGTGTT‑TGCGATGGTGATGGGAGAAg > 2:190043/1‑300 (MQ=21) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAGTATTTACNTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTAGCNCCTTCGACGTCACTAACAACAGGTTTCAA‑GTCTGCTGACGTTGGCCGCTCGGGAACACCCAA‑AGAGGTAATTCACATCTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGggagga > 2:688241/1‑300 (MQ=17) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTCCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCAACAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGa > 1:148191/1‑300 (MQ=255) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAGTGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGa > 1:113657/1‑300 (MQ=255) gagtACTCAGCGCTTAGCGCTTCTCCCTTCGGTTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGGAAGTTCATGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAAAATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAGTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGat < 2:231422/297‑1 (MQ=25) 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ccccttngggatgtgtataaggCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCNTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAccc < 2:727860/280‑1 (MQ=255) cccctgngagatgtgtataatagacagCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCNTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAccc < 2:727850/274‑1 (MQ=38) cccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCAccc < 1:412505/300‑1 (MQ=255) 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TCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG‑GGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACA‑GTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAC‑CCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCT‑TGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAC > NC_000913/1287034‑1287624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |