| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
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CCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGNCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCNATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA > 2:819369/1‑300 CCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCCATCGGA > 1:271143/1‑300 CCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCAATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA > 2:56387/1‑300 AAATCGTGTTGAGGCCAACGCCCATAATGCGGGCTGTTGCCCGGCATCCAACGCCATTCATGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAA‑CACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978975‑1979270‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA < NC_000913/4541023‑4540726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |