| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 80,529 | C→G | G112G (GGG→GGC) | leuC ← | 3‑isopropylmalate dehydratase subunit LeuC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 80,529 | 0 | C | G | 99.0% | 372.1 / NA | 101 | G112G (GGG→GGC) | leuC | 3‑isopropylmalate dehydratase subunit LeuC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (44/56); minor base T (0/1); total (44/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGGATTGCTTCGCCGCAAAACTCCACCACATGCCCGGTGCCGCCTGCGCTACCGGTTTTACCGATAATTGCCAGCACGATATCTTTTGCGGTAATGCCCGGCGCGGCTTTGCCCTGGACTTCAATTTTCATGGTTTTTGCGCGGCCCTGTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCATTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTCGTACAC > NC_000913/80239‑80822 | cGGATTGCTTCGCCGCAAAACTCCACCACATGCCCGGTGCCGCCTGCGCTACCGGTTTTACCGATAATTGCCAGCACGATATCTTTTGCGGTAATGCCCGGCGCGGCTTTGCCCTGGACTTCAATTTTCATGGTTTTTGCGCGGCCCTGTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGGCCCATTACg > 1:187612/1‑300 (MQ=255) ttGCTTCGCCGCAAAACTCCACCACATGCCCGGTGCCGCCTGCGCTACCGGTTTTACCGATAATTGCCAGCACGATATCTTTTGCGGTAATGCCCGGCGCGGCTTTGCCCTGGACTTCAATTTTCATGGTTTTTGCGCGGCCCTGTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGGCCCATTACGTGGa > 2:448971/1‑300 (MQ=255) ttGCTTCGCCGCAAAACTCCACCACATGCCCGGTGCCGCCTGCGCTACCGGTTTTACCGATAATTGCCAGCACGATAGCTTTTGCGGTAATGCCCGGCGCGGCTTTGCCCTGGACTTCAATTTTCATGGTTTTTGCTCGGCCCTGTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTATTCCGGGCCCATTACGTGGa < 1:143404/300‑1 (MQ=255) aaaCTCCACCACATGCCCGTTGCCGCCTGCGCTACCGGTTCTACCGAGAAGTGCCAGCACGATATCTTTTGCGGTAATGCCCGGCGCGGCTTTGCCCTGGACTTCAATTTTCATGGTTTTTGCGCGGCCCTGTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCACAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATa < 2:325876/300‑1 (MQ=255) 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gCCCTGTTCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCATTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTc > 1:42733/1‑300 (MQ=255) gCCCTGTTCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCATTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTc > 2:377092/1‑300 (MQ=255) gTTCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCATTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTCGTaca > 2:481529/1‑300 (MQ=255) ttCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGTTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCNTTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGTTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTCGTacac < 1:596811/300‑1 (MQ=255) ttCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGTTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCATTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTCGTacac < 1:99370/300‑1 (MQ=255) ttCCGGGCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCNTTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAGGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTCGTacac < 1:597402/300‑1 (MQ=255) | CGGATTGCTTCGCCGCAAAACTCCACCACATGCCCGGTGCCGCCTGCGCTACCGGTTTTACCGATAATTGCCAGCACGATATCTTTTGCGGTAATGCCCGGCGCGGCTTTGCCCTGGACTTCAATTTTCATGGTTTTTGCGCGGCCCTGTTTCAGGGTTTGCGTTGCCAGTACGTGTTCAACTTCGGAAGTGCCGATACCAAAGGCCAGTGCGCCAAACGCGCCGTGGGTGGCGGTATGCGAGTCGCCGCAGACAATGGTCATCCCCGGCAAGGTGACGCCCTGTTCCGGCCCCATTACGTGGACGATCCCCTGATACGGGTGATTCAGGTCATACAGTTCGACGCCAAATTCTTTGCAGTTTTTGATCAGTTCCTGCATCTGGATACGCGCCATTTCACCGCAGGCATTAATGTCTTTGGTCTGGGTAGAGACGTTGTGATCCATGGTAGCGAAGGTTTTGCCCGGCTGACGTACCGGGCGACCGTGGGCGCGCAGACCATCGAACGCCTGCGGTGAGGTCACTTCATGCACCAGGTGGCGGTCGATATATAACAGTGGGGTTTCGTTTTCGGCTTCGTACAC > NC_000913/80239‑80822 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |