New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2357664 | 124 (1.130) | 7 (0.070) | 7/576 | 8.8 | 6.0% | coding (761/900 nt) | rpnE | inactive recombination‑promoting nuclease‑like protein RpnE |
? | NC_000913 | 2357848 = | 100 (0.940) | intergenic (+45/+194) | rpnE/yfaU | inactive recombination‑promoting nuclease‑like protein RpnE/2‑keto‑3‑deoxy‑L‑rhamnonate aldolase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCC > NC_000913/2357366‑2357963 | cTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAggg > 1:171037/1‑300 (MQ=255) ggATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAAt > 1:435670/1‑300 (MQ=255) ggATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTA‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACNAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAAt > 2:624792/1‑300 (MQ=255) ggATATCAACATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAAt > 1:434970/1‑300 (MQ=255) atatCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATtg > 2:370262/1‑300 (MQ=255) tatCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAGTCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCAAGCTACAAACACGGTTTACTTATCTGTTGCACTGGGGCGATAC‑TCACCTTTTACCCCGTTTTATTGAGGGGATTGCAGAATGTCCACCACTACAAAAGGAGAAATTAATGATTATTGCTAAATGGCTATGGCAGGAAGGGCCTCAAAtcgg > 2:231158/1‑297 (MQ=255) tatCAACATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATtgg > 2:231253/1‑300 (MQ=255) aCCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAgg < 2:664388/300‑1 (MQ=255) aCCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAgg < 1:761761/300‑1 (MQ=255) cGATTAGATCATGCGACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCa < 2:55870/300‑1 (MQ=255) cGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCa > 1:653469/1‑300 (MQ=255) cGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTA‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTAAGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCa > 2:24478/1‑300 (MQ=255) gATGAGATCAGGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCGGGAACTGATTCAAGAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCAt < 1:277296/300‑1 (MQ=255) aTGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATg < 1:32282/300‑1 (MQ=255) agaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTTAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAAc < 1:670815/300‑1 (MQ=255) agaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAAc < 1:558776/300‑1 (MQ=255) agaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAAc > 2:764250/1‑300 (MQ=255) gaTCAGGCAACATCGGCGTAGAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATGGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGATAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACa < 2:117894/300‑1 (MQ=255) aCATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTaa > 1:514475/1‑300 (MQ=255) gCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGc > 1:55668/1‑300 (MQ=255) gCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGc > 2:145759/1‑300 (MQ=255) gCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGNTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCNGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGc > 2:678554/1‑300 (MQ=255) gTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCAAGCTTTTGGTTAGAGGCTTAACTAATGACAGCCAGCTACCAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑ACGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCACTTAAAATTGCtt > 1:397809/1‑300 (MQ=255) gCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTA‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCAATTAAAATTGCTTTgcgc > 2:121014/1‑300 (MQ=255) tgctgGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATCGCTTTGCGCATGc > 2:265809/1‑300 (MQ=255) aaCTGGTTCAAAAACATGGTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACCGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATGGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 2:456624/300‑1 (MQ=255) aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 1:195001/300‑1 (MQ=255) cggATTCAAAAGCATAGTCGCGACCGCGATTGAATCTGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGAGACCGC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTTATGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCGGAACGGCTACGGCAGGAAGTGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGTGCATGCTGGAGCAg < 1:271159/298‑1 (MQ=255) aTTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGc < 1:281668/300‑1 (MQ=255) aTTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCAATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGc > 1:51657/1‑300 (MQ=255) aGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAAc < 1:328432/300‑1 (MQ=255) aGCATATGCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAAc < 1:327884/300‑1 (MQ=255) gCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCNC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGNTTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACACGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGCGCAGAGCTTTGAACg > 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1:621943/1‑300 (MQ=255) gTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCAACCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAACTTGCTTTGCGCATGCTGGCGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCCACCCACt > 1:768464/1‑300 (MQ=255) tCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGTCTTCACTAATAACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTTAGGAGATTGCCGAACGTTNACCACTACAAAAGTAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGTGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTg < 2:201612/300‑1 (MQ=255) 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ttGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATc > 1:267571/1‑300 (MQ=255) ttGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTNTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATCCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTNATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATc < 2:691186/300‑1 (MQ=255) tcgCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCCGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCGGGAGCAGGGCTGTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTTTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTATAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATc < 2:109071/298‑1 (MQ=255) accGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAGTTGGCTGGCAGTAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGAcc < 2:5211/298‑1 (MQ=255) ggCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCGGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAgg < 2:499265/300‑1 (MQ=255) tACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATAAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGTGCTGGGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATGTTCCGAACTTTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCGGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGCTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGc < 2:431405/300‑1 (MQ=39) cGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGGATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTc > 2:500507/1‑300 (MQ=255) ggCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTcg > 1:21802/1‑300 (MQ=255) ggAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATNGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGc < 2:640666/300‑1 (MQ=255) ggCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCAccc < 1:24509/300‑1 (MQ=255) | CTGTTGGTGGATATCACCATCGTACCTGACGATGAGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTC‑CCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCC > NC_000913/2357366‑2357963 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |