New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1287084 | 66 (0.600) | 9 (0.090) | 8/558 | 8.2 | 12.9% | noncoding (153/171 nt) | rttR | small RNA RttR |
? | NC_000913 | 1287557 = | 60 (0.580) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGAT > NC_000913/1286789‑1287380 | gcTCAAGTCGAACTTGGGTCGAAGTTTCTCACCCTTCCCCGCGTGGTCAGAATATGTGATTGCGGATTCGTTTTAGAGTTCCGTGGCTTTGGAAATTGATGGTGGTGGGTGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 2:392041/300‑1 (MQ=17) gcTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGNGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:582621/300‑1 (MQ=255) agtctacctttGGTCGGAGCGTCTCACCCTTCACCGCGTGGGCAGAGTATGTGATTGCGGATTCGTGGGAGAGTTTCGGGGCTTGTGAAATTGATGGTGGTGGGGGGAGGATTACTCAACGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGGCGTTGTCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCNCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATGTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAANTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 2:594309/291‑1 (MQ=17) aGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTTATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATGTTTGATTGTGGATGCGTGGGAGGATTTCGGGGTTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:798608/300‑1 (MQ=17) aGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAgcgc < 1:134086/300‑1 (MQ=255) gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGANGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAccccgctct > 2:751540/1‑292 (MQ=255) gTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGACGCTTCTCCTCCTTCCCAGCATGGGCAGAATATTCGATTGCGGATTCGCTTT‑AGAGTTCCGGGATTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACCCAGCGCt > 2:396650/1‑300 (MQ=17) ccTTGGNCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGANTCGTGTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCACATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTgcgcgc < 2:694238/300‑1 (MQ=255) aagattCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCtt < 1:436840/296‑1 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGCTTGCGGATTCGCTGG‑AACGTTCAGGGACTTCTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcatcaatgctacgttctccacccccag > 2:82389/1‑273 (MQ=14) ttCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTCCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGCGCTGCGCTCTTCGCCCTTCgtg > 2:246145/1‑298 (MQ=255) ttCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCt > 1:516967/1‑300 (MQ=255) cGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCCTGGTGAGAATATTCGATTGCTGATTCGCTTT‑ATAGTCCCGGTACTTTTGACATTGCTGGTAGTGGGGGAAAGATTCCCCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTCCGGGTCGTTGCCTGCGGc > 1:25794/1‑300 (MQ=18) gAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCCGCGCTACGTACTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCCCTCTCGCTGACGCTCGCGCAGAACCCTAGTCGCAGCTTATCATCCTCCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCAGATTCACTTG‑AGCATTCAGGGCCTTTTAAAAGTAATGGTGGGGGGGGAAGGATCACCCAACGCTGCGTACTCCTCCCTCCGGGTCTTTGCCTGCGGCGACGctctct > 2:472185/1‑300 (MQ=12) gAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTAGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctctct > 1:27528/1‑300 (MQ=255) atatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGACAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCATGCCTCGCTCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGACCTCTCg > 2:315564/1‑300 (MQ=17) atatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCg > 1:394591/1‑300 (MQ=255) gatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGc < 1:639831/299‑1 (MQ=255) tttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCCTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTGACGCCCGAGCCGAACCTTAGTCGACGTTTATAATCCTTACAAGCATGGGAAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGCGTCCAGGGACTTTTGAAAGTGGTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGAGCGCTCGGCCCTTCGGGTCGTTGATTGCAGAAACGCTCCCCCGCTAGCGATCTAGTCGaccc > 2:334505/1‑297 (MQ=17) 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aTGGTGGTGGGGGAAGGACTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 1:789616/300‑1 (MQ=255) tggtggtggGTGAAGAATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGAGGTAACGCGCGCGCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCGTAGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATGTGATTGCGGATTAGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 1:857090/300‑1 (MQ=14) gggAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTCAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCgatgagtgcaaa > 1:561846/1‑289 (MQ=14) 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aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCgatgagtgcaaactttcacaat > 2:220491/1‑279 (MQ=14) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGGAGAATATTTGATTGCGGATTGGATTG‑AAAGTTTAGGGACTGTTGAAGGTGATGGTGGTGGGGGAAGGCTTACTCATCGCTGCGCCCCTCGCCCTCCGAGCCGCTGCATACAACACCACTCTCTCGATGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCATTACCCGCATGGGCAGAGTATTTAATTGCGGAt > 1:495705/1‑300 (MQ=14) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGAt > 1:30808/1‑300 (MQ=255) 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GCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTG‑AGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGAT > NC_000913/1286789‑1287380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |