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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
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AAGTTGGCAGCATCACCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTATGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATA > 2:836468/1‑300 AGTTGGCAGCATCACCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATAT > 2:715330/1‑300 TTGGCAGCATCACCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATAT < 1:373477/300‑1 CACCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCG > 2:105082/1‑300 CACCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCG > 1:53174/1‑300 CCTAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA > 1:209727/1‑300 AATCGTGTTGAGGCCAACGCCCATAATGCGGGCTGTTGCCCGGCATCCAACGCCATTCATGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978976‑1979270‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAGGAGTGATTCGATTTCACTATGGGTCAGGAAGTTCCTTTTTTTGTTATCAGCCTTATTCTTCATCGTTTTTCCCTTATAATTACAGACGCGCACTAGCTGTGCTGGGTTAGCAATAATCCAACATTTTTATCCTGATTATGTTTATAAAAGCGAACGTTTGCTTAATAACTAACGTAAGTGGACCAGTTCTTCTGAGTGAACTTAAATGGAGTAGCAACTGTTAATTATAATAACGTTGCCATACAAACGCCATGCTCTTGCATGCTATGTACCTTTATATATTTATCAATCGGA < NC_000913/4541023‑4540726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |