Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,327,354 | C→T | A168V (GCT→GTT) | rluB → | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,327,354 | 0 | C | T | 99.0% | 373.4 / NA | 104 | A168V (GCT→GTT) | rluB | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGTGTTCGTTACGGTGATATCCCACTGCCAAAAGGTCTGCCACGCGGTGGCTGGACGGAGCTGGACCTCGCCCAGACTAACTATCTGCGCGAACTGGTGGAGCTACCGCCAGAAACCAGCTCTAAAGTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCG > NC_000913/1327064‑1327633 | cTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATNCCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCNATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGTTTTTAAAAc > 2:585822/1‑300 (MQ=255) 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gATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGTAGTTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGTGTTCGTTACGGTGATATCCCACTGCCAAAAGGTCTGCCACGCGGTGGCTGGACGGAGCTGGACCTCGCCCAGACTAACTATCTGCGCGAACTGGTGGAGCTACCGCCAGAAACCAGCTCTAAAGTc > 2:661261/1‑300 (MQ=255) gTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGTTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGTGTTCGTTACGGTGATATCCCACTGCCAAAAGGTCTGCCACGCGGTGGCTGGACGGAGCTGGACCTCGCCCAGACTAACTATCTGCGCGAACTGGTGGAGCTACCGCCAGAAACCAGCTCTAAAGTCGCTGTAGaaa < 1:227402/300‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGTTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGTGTTCGTTACGGTGATATCCCACTGCCAAAAGGTCTGCCACGCGGTGGCTGGACGGAGCTGGACCTCGCCCAGACTAACTATCTGCGCGAACTGGTGGAGCTACCGCCAGAAACCAGCTCTAAAGTCGCTGTAGAAAAAGAc > 1:651060/1‑300 (MQ=255) 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CTATTACAAACCGGAAGGTGAGTTGTGTACCCGTAACGATCCGGAAGGACGTCCAACGGTGTTTGACCGTCTGCCAAAACTGCGTGGCGCACGCTGGATTGCCGTGGGTCGCTTGGACGTTAATACCTGTGGTCTGCTGCTGTTCACCACCGATGGTGAACTGGCAAACCGTTTAATGCACCCAAGCCGTGAAGTTGAACGTGAATATGCCGTGCGTGTATTTGGTCAGGTTGACGACGCGAAACTGCGTGATTTGAGTCGTGGCGTGCAGTTGGAAGATGGTCCGGCAGCTTTTAAAACCATCAAGTTCAGCGGCGGCGAAGGGATCAACCAGTGGTACAACGTGACTCTGACCGAAGGCCGTAACCGTGAAGTTCGTCGTCTGTGGGAAGCGGTTGGTGTGCAGGTGAGCCGCCTGATCCGTGTTCGTTACGGTGATATCCCACTGCCAAAAGGTCTGCCACGCGGTGGCTGGACGGAGCTGGACCTCGCCCAGACTAACTATCTGCGCGAACTGGTGGAGCTACCGCCAGAAACCAGCTCTAAAGTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCG > NC_000913/1327064‑1327633 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |