| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 92,327 | G→T | P305P (CCG→CCT) | ftsI → | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 92,327 | 0 | G | T | 98.9% | 342.5 / NA | 93 | P305P (CCG→CCT) | ftsI | peptidoglycan DD‑transpeptidase FtsI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (51/41); minor base C (1/0); total (52/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCAGCGTTAGTAGATACTTACTCACGTTTTGGACTGGGAAAAGCGACCAATTTGGGGTTGGTCGGAGAACGCAGTGG > NC_000913/92037‑92608 | gtgCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCCGGCtacaag > 2:149926/1‑295 (MQ=255)gtgCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGAAGTGTTTGAACCTGGCTCAACg > 2:50434/1‑300 (MQ=255) aggACCGCTATGGTCGCGTAATTTAAGATACTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAAc < 2:169618/298‑1 (MQ=255) aGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCTGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGTTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGATGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAAcc < 2:497378/300‑1 (MQ=255) 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aCCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATa > 2:331482/1‑300 (MQ=255) aCCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATa > 1:61509/1‑300 (MQ=255) ccTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAATGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCTGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTGATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATAc < 2:189590/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |