| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,262,279 | Δ6,678 bp | [fruK]–[lpxT] | [fruK], fruB, setB, yeiW, yeiP, yeiQ, yeiR, [lpxT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 2262279 | 2268956 | 6678 | 87 [0] | [0] 86 | [fruK]–[lpxT] | [fruK],fruB,setB,yeiW,yeiP,yeiQ,yeiR,[lpxT] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2262278 | 0 (0.000) | 86 (0.780) | 66/596 | 0.3 | 100% | coding (88/939 nt) | fruK | 1‑phosphofructokinase |
| ? | NC_000913 | 2268957 = | 0 (0.000) | coding (104/714 nt) | lpxT | lipid A‑core phosphotransferase | |||||
CGTCAGGGCGATGACCTGCACATTGAAACGCAAAACGTTGCGCCACCGGACAGCCGTATTGAGCTGATTTCCAGCAGCGAAGCTGACTGGAATGCCTTGCAGAGCGCGCTGTTGAAGCTTCGTTTAGCGACTACCGCGTAAGGTTGCCTGCGTTTTTCAGTAAGATAATTAGAGAAAATATGATTAAAAATTTGCCGCAAATAGTGTTGTTGAATATTGTCGGCCTCGCGCTGTTTCTTTCCTGGTATATCCCCGTTAATCATGGATTCTGGTTGCCGATTGATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAAC > NC_000913/2268675‑2269250 | agtcacaaagcgttcccagtcggcgggggtgacttcaaaaccctagaagttgaggtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTAtt < 2:235018‑M2/18‑1 (MQ=255) gtcacaaagcgttcccagtcggcgggggtgacttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTAttt > 1:445734‑M2/282‑300 (MQ=255) gtcacaaagcgttcccagtcggcgggggtgacttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTAttt > 2:653947‑M2/282‑300 (MQ=255) gcgttcccagtcggcgggggtgacttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATc > 2:731854‑M2/274‑300 (MQ=255) ccagtcggcgggggtgacttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaanggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAAc < 1:621350‑M2/33‑1 (MQ=255) gacttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGATCGAAAGTAAgg > 2:27477‑M2/253‑300 (MQ=255) acttcaaaacccgagaagttgaagtcggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGc < 1:135843‑M2/49‑1 (MQ=255) 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gaagtcggtcacttcgccgtcttttttcgttagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaaccttgaaacggttggcaatgcccagctcgcggaacagttgctgaaaaccatcctgattggctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCAt < 2:48616‑M2/69‑1 (MQ=255) ggtcacttcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttttaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACca > 1:771734‑M2/226‑300 (MQ=255) tcgccgtctttttccgtcagcttaacgttaattcgggtgcgcccctgtacaacctggaaacggttggcaatgcccagctcgctgaacagttgctgaaaaccatcctgattgtctttacccaggaagccgccaacggtgacatcaattcccaggtcttgtaatactttggccacgttgatgcctttacccgccgcatgcagaccggtggttttcaccagATGCGGATATTTTTTATTTCTTTAATCAGAAACTGGTCGAAAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATcg < 2:357604‑M2/82‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |