| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 69481 = | 78 (0.710) | 97 (1.010) +TGACTGACTGAGATCTCGAGTCTGATGACGAAGCTCCC |
60/522 | 0.3 | 52.6% | coding (568/1701 nt) | araB | ribulokinase |
| ? | NC_000913 | 3212634 = | 122 (1.100) | coding (1528/1746 nt) | dnaG | DNA primase | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
ATCTTCGTCAGGAATTAGGCAACAAATTAGGCATACTTGATGACAGCCAGCTTGAACGATTAATGCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAGTAC > NC_000913/3212335‑3212931 | atCTTCGTCAGGAATTAGGCAACAAATTAGGCATACTTGACGACAGCCAGCTTGAGCGATTAATGCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTa < 2:738465/300‑1 (MQ=255) gccgaaaacccgaacgcgatgttcgtattgtggaaagaccacactgcggttgaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCAcc > 1:823033‑M2/283‑300 (MQ=255) aacttAGGCATACTTGATGACAGCCAGCTTGAACGATTAATGCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTACCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGaa > 1:330447/4‑300 (MQ=255) cTTGATGACAGCCCGCTTGAACGATTAATGCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGAtg > 2:44794/1‑300 (MQ=255) cTTGATGACAGCCAGCTTGAACGATTAATGCCAAAAGCGGCAGGGAGCGGCGCTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGTTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCAAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCAAACATTGAAAAACTGTCGAtg > 2:7411/1‑300 (MQ=255) cTTGATGACAGCCAGCTTGAACGATTAATGCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGAtg > 1:491515/1‑300 (MQ=255) atgttcgtattgtggaaagaccacactgcggttgaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGAtg > 1:754751‑M2/265‑300 (MQ=255) gtattgtggaaagaccacactgcggttgaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGAc < 1:100300‑M2/42‑1 (MQ=255) attgtggaaagaccacactgcggttgaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGa > 1:720615‑M2/257‑300 (MQ=255) gtggaaagaccacactgcggttgaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGatat > 1:105121‑M2/254‑300 (MQ=255) 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actgcggtggaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAat < 1:213211‑M2/60‑1 (MQ=255) ggttgaaagaagcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGc < 1:425942‑M2/65‑1 (MQ=255) gCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGc < 2:177366/300‑1 (MQ=255) aaGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTACCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCAACCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATCTTGCTGAGc > 2:244265/1‑300 (MQ=255) agcgaatagattacccgtttgtgccacgtgccgtgcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAAcc < 2:442454‑M2/75‑1 (MQ=255) agcgaagagattacccgtttgtgccacgcgccgggcaatgttgactactcccgctatattggcggtatttattccagcgaatggttctgggcaaaaatcctgcatgtgactcgccaggacagcgccgtggcgcaatctgccgcatcgtggattgagctgtgcgactgggtgccagctctgctttccgtgactgactgagatctcgagtctgatgacgaagctcccACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAAcc < 1:529213‑M2/75‑1 (MQ=255) 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cTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAatat > 2:721481/1‑300 (MQ=255) gTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGNTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGANGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAg < 2:679057/300‑1 (MQ=255) gTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAg < 1:506877/300‑1 (MQ=255) gTGGTACAAATAATGCTGCCACCCGTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAg < 2:460942/300‑1 (MQ=255) ggTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAGTa < 1:410619/300‑1 (MQ=255) gTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGNACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAGTAc > 1:626309/1‑300 (MQ=255) | ATCTTCGTCAGGAATTAGGCAACAAATTAGGCATACTTGATGACAGCCAGCTTGAACGATTAATGCCAAAAGCGGCAGAGAGCGGCGTTTCTCGCCCTGTTCCGCAGCTAAAACGCACGACCATGCGTATACTTATAGGGTTGCTGGTGCAAAATCCAGAATTAGCGACGTTGGTCCCGCCGCTTGAGAATCTGGATGAAAATAAGCTCCCTGGACTTGGCTTATTCAGAGAACTGGTCAACACTTGTCTCTCCCAGCCAGGTCTGACCACCGGGCAACTTTTAGAGCACTATCGTGGTACAAATAATGCTGCCACCCTTGAAAAACTGTCGATGTGGGACGATATAGCAGATAAGAATATTGCTGAGCAAACCTTCACCGACTCACTCAACCATATGTTTGATTCGCTGCTTGAACTGCGCCAGGAAGAGTTAATCGCTCGTGAGCGCACGCATGGTTTAAGCAACGAAGAACGCCTGGAGCTCTGGACATTAAACCAGGAGCTGGCGAAAAAGTGATTTAACGGCTTAAGTGCCGAAGAGCGATCGGGAAGCCCCCGACAGCCGCACTGAGAGGCAGCGGCAAATATATAAGTAC > NC_000913/3212335‑3212931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |