| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1317293 | 116 (1.050) | 106 (1.060) +GCAAGCTGATCTCAGTCAGTCAAGCTCCC |
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| ? | NC_000913 | = 3212929 | 109 (0.990) | intergenic (+77/‑118) | dnaG/rpoD | DNA primase/RNA polymerase sigma factor RpoD | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TGGCGTTTTGAATCGTCGGGCCATCCGCCAGTGGGTCGGAGAAGGGGATACCTAACTCCAGCGCGTCAGCACCGGCTTCAATTAGCGTATCGATAATTTTCAATGACTGCTCAATGCCCGGATCACCGAGCGTGACGAAAGGAACGAATGCGCCTTCTTTGCGCTCCTTCAACTGGGCAAACAGAGATTCGTAGCGTTCCATCAGATTTCCCCTCGTGCTTTCAAAATATCGTGAACGGTGAAGATGTCTTTATCGCCGCGACCGGAAAGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1317021‑1317293‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTCCTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTCGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATATTCTTATCTGCTATATCGTCCCACATCGACAGTTTTTCAAGGGTGGCAGCATTATTT < NC_000913/3212929‑3212636 ||||||||||||||||||||||||||||| aaacgacggccagtgaatccgtaatCGCCAGTGGGTCGGAGAAGGGGATACCTAACTCCAGCGCGTCAGCACCGGCTTCAATTAGCGTATCGATAATTTTCAATGACTGNTCAATGCCCGGATCACCGAGCGTGACGAAAGGAACGAATGCGCCTTCTTTGCGCTCCTTCAACTGGGCAAACAGAGATTCGTAGCGTTCCATCAGATTTCCCCTCGTGCTTTCAAAATATCGTGAACGGTGAAGATGTCTTTATCGCCGCGACCGGAAAGGTTGCAAGCTGATCTCAGTCAGTCAAGCTC < 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ACCGGAAAGGTTGCAAGCTGATCTCAGTCAGTCAAGCTCCCCCTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTACTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTCGGTGAAGGTTTTCTCCTCACTATTCTTATCTGCTATATCGTCCC > 2:293186/1‑300 GCTGATCTCAGTCAGTCAAGCTCCCACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTCCTGGCGCAGTTCAAGCAACGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTAGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATACTCTTATCTGCTATATCGTACCACATCGACAGTTTTTC > 2:79736/1‑300 GATCTCAGTCAGTCAAGCTCCCACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTCCTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTCGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATATTCTTATCTGCTATATCGTCCCACATCGACAGTTTTTCAAG > 1:175878/1‑300 GTCAAGCTCCCACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTCCTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTCAGTGAGTCGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATATTCTTATCTGCTATATCGTACCACATCGAACGTTTTTCAAGGGTGGCAGCAT > 2:514916/1‑300 CAAGCTCCCACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTCCTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTCGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATATTCTTATCTGCTATATCGTCCCACATCGACAGTTTTTCAAGGGTGGCAGCATTA > 2:820041/1‑300 GCTCCCACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATNCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTNCTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTCGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATATTCTTATCTGCTATATCGTCCCACATCGACAGTTTTTCAAGGGTGGCAGCATTATTT < 2:561400/300‑1 ||||||||||||||||||||||||||||| TGGCGTTTTGAATCGTCGGGCCATCCGCCAGTGGGTCGGAGAAGGGGATACCTAACTCCAGCGCGTCAGCACCGGCTTCAATTAGCGTATCGATAATTTTCAATGACTGCTCAATGCCCGGATCACCGAGCGTGACGAAAGGAACGAATGCGCCTTCTTTGCGCTCCTTCAACTGGGCAAACAGAGATTCGTAGCGTTCCATCAGATTTCCCCTCGTGCTTTCAAAATATCGTGAACGGTGAAGATGTCTTTATCGCCGCGACCGGAAAGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1317021‑1317293‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTTATATATTTGCCGCTGCCTCTCAGTGCGGCTGTCGGGGGCTTCCCGATCGCTCTTCGGCACTTAAGCCGTTAAATCACTTTTTCGCCAGCTCCTGGTTTAATGTCCAGAGCTCCAGGCGTTCTTCGTTGCTTAAACCATGCGTGCGCTCACGAGCGATTAACTCTTCCTGGCGCAGTTCAAGCAGCGAATCAAACATATGGTTGAGTGAGTCGGTGAAGGTTTGCTCAGCAATATTCTTATCTGCTATATCGTCCCACATCGACAGTTTTTCAAGGGTGGCAGCATTATTT < NC_000913/3212929‑3212636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |