| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,556,867 | 0 | G | A | 99.4% | 591.9 / NA | 161 | intergenic (+70/‑46) | ytiD/idlP | protein YtiD/iraD leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (62/98); minor base C (1/0); total (63/98) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
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ggATTCAGACCTGTCTCAGACTGACATGGATGTAATGAACAAAAGTGAATGGCTATGGAAAATGAGCATCAATACAGTGGTGCCCGGTGTTCAGGGCAAGCCGCATATGTTGCTAAACGTCAGGAGTGCGCAAAATGATGCGACAATCACTTCAGGCTGTTTTACCTGAAATTTCAGGCAATAAAACGTCATCGCTGCGTAAATCGGTATGCAGCGATCTCCTCACTCTTTTTAATTCTCCTCATTCGGCATTACCGTCATTACTTGTTTCAGGCATGCCCGAGTGGCAAGTGCATAAcc < 1:183181/300‑1 (MQ=255) gATTCAGACCTGTCTCAGACTGACATGGATGTAATGAACAAAAGGGAATGGCTATGGAAAATGAGCATCAATACAGTGGTGCCCGGTGTTCAGGGCAAGCCGCATATGTTGCTAAACGTCAGGAGTGCGCAAAATGATGCGACAATCACTTCAGGCTGTTTTACCTGAAATTTCAGGCAATAAAACGTCATCGCTGCGTAAATCGGTATGCAGCGATCTCCTCACTCTTTTTAATTCTCCTCATTCGGCATTACCGTCATTACTTGTTTCAGGCATGCCCGAGTGGCAAGTGCATaaacc > 1:130239/1‑297 (MQ=255) aTTCAGACCTGTCTCAGACTGACATGGATGTAATGAACAAAAGGGAATGGCTATGGAAAATGAGCATCAATACAGTGGTGCCCGGTGTTCAGGGCAAGCCGCATATGTTGCTAAACGTCAGGAGTGCGCAAAATGATGCGACAATCACTTCAGGCTGTTTTACCTGAAATTTCAGGCAATAAAACGTCATCGCTGCGTAAATCGGTATGCAGCGATCTCCTCACTCTTTTTAATTCTCCTCATTCGGCATTACCGTCATTACTTGTTTCAGGCATGCCCGAGTGGCAAGTGCATAACCCg > 1:800749/1‑300 (MQ=255) | TGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGTTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAATATTCAGAATATACTAGCGGTTTTTTTTTGAGTTTGATGATTTTTATCAAATCATGACTTTTTTCCTGAAAAGTCAGTAGATATTCATAGGCAAGTAAGGTTTTATACTTTGCTGACAGGATTCAGGCCTGTCTCAGACTGACATGGATGTAATGAACAAAAGGGAATGGCTATGGAAAATGAGCATCAATACAGTGGTGCCCGGTGTTCAGGGCAAGCCGCATATGTTGCTAAACGTCAGGAGTGCGCAAAATGATGCGACAATCACTTCAGGCTGTTTTACCTGAAATTTCAGGCAATAAAACGTCATCGCTGCGTAAATCGGTATGCAGCGATCTCCTCACTCTTTTTAATTCTCCTCATTCGGCATTACCGTCATTACTTGTTTCAGGCATGCCCGAGTGGCAAGTGCATAACCCG > NC_000913/4556575‑4557160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |