| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4392437 | 101 (0.940) | 5 (0.060) | 5/442 | 5.9 | 6.3% | intergenic (+2/‑35) | glyV/glyX | tRNA‑Gly/tRNA‑Gly |
| ? | NC_000913 | 4392661 = | 73 (0.920) | intergenic (+3/‑231) | glyY/yjeV | tRNA‑Gly/uncharacterized protein YjeV | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAAT > NC_000913/4392372‑4392957 | cAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCa > 1:358062/1‑300 (MQ=255) tttGGTAGGGCGCGGCCTTGCTAAGGTCGTGGTCTCGAGGTCAATTCTCGTGGCCC‑GCTACAAAATTGGAAAAGTGCGGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAAGAGCTAATTTGTTAGAACACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAGTTGGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGTTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAAt < 2:220685/299‑1 (MQ=17) gTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATaaaa > 1:127103/1‑300 (MQ=255) aCGACCTTGCCAAGGTCGGTGTTGTGGGTTCGATTC‑CCTTTCCCAGCTCCAAAATTTGGAAAGTGCTACAAAACACAGACCAACAAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTGGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCGGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCcac < 2:262594/300‑1 (MQ=17) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAGTTTGAAAAGTGCGGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGc < 1:111677/300‑1 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGCCACGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAAACCACCAAAGCGGGAATGGCTTAGGTGGTAGCGCACGACCCTGACAAGGTCGGGGCCGTGAGTTTGAGTCCCGTTTCCCGCTCAAAATCCTTCCCTCAATAAGATATCCACAGc > 2:416303/1‑300 (MQ=18) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTCGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGCTCAAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCAAATCCTTATCTAAATAAAATATCCCCAGc > 1:738901/1‑300 (MQ=21) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTCAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAACATATCCACAgt > 1:329081/1‑299 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATACAATATCCACAGc > 1:822793/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAAACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAGTTTGAAAGTACTGTAAGGCATAGATCACCCAATCGGGCATAGCTCAGTTGGTGGAGCACGACCTTGCCACGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAtccttaccccgctaaaacattcacagc > 2:470451/1‑278 (MQ=21) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATCTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGCATAGCTCAGTTGGTAGGGCACGACCTCACCAATGTCAGGATCGTGAGCTCGAGTCTCGTTTCTCGCTCCAAACTTTAAAAGCGCTGTAAGGCACAAACCACACCAGCGGGAATAGTTCAGGTGGTAGAGCCAGACCCCGCCCAGGTCGGGGCCGCTCGCTCGAGTCCCGCTTCCCGCTCCCCAttcttacaccaatagaccatccccagc > 2:24803/1‑278 (MQ=9) aCCTTGCCAAGGTATGGGTCGCGAGTTCTAGTCTCTTTTCCC‑GCTCCGAAATTTGAAAAGGACGGCAAAGCACAGATCGCCACAGCGGGAAGAGCTCAGTTGGTAGGGCACGACCTTGCTAAGGGCGGGGTCGAGAGTGCGAGTCTCGTTGCCAGCTCAAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGc < 2:729106/300‑1 (MQ=18) gCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGAcgc > 1:20535/1‑300 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGAGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATgt > 1:707650/1‑299 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCA‑GCTCCAAAATTTAAACAGTGCCGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCCGTTGGTAGAGCCCGACCTTGCCACGGTCGGGGTCGCGAGTTTGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAAACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGGGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGCCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTACAGCTCCAAATTTTTCTCTCACTAAAATATCCACAGTGACGCGATgt > 1:454768/1‑299 (MQ=25) tggTCGCGAGTGTTAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGTTGCAAAATACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGACCTTGCCAAGTTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCACGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTAt < 2:42371/299‑1 (MQ=21) agttctattctcGTTACCC‑GCTCCAAAATTTTAAAAGTACGACAAAGCACAGACCACCCAAGCTGGAAGAACTCAGTTGGTAGAGCACGACCTGGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGATTCTCGTTTCCCGCTCCAAACTTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGtt < 2:472524/292‑1 (MQ=21) taGTCTCTTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTttgt < 1:416528/299‑1 (MQ=255) ctcGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCCGGTTTTTGTTGtc > 1:321536/1‑300 (MQ=255) gTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCNAAATTTGACAGTGCTGTAAGGCACAANACACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGCACTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGCGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCCAATTCTTACAGCAATGAAATATCCAAAGCGACGCGATGTGGTACTACTGGTCTTTGTTTtctac > 2:555494/1‑298 (MQ=18) tttaaaaGTGCTGCAAAGCACAGATCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCTGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAAc < 1:114256/297‑1 (MQ=255) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGACAGTGCTGTAAGGCACAGAACACCAAAGCGGGAATCGCCCAGCTGGTAGCACACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGCGTTCGAATCTCGTTTCCCGCCCCACATTTTTCTCTCAATACCATATCCAAAGTGACGCTATGTTCTCGTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGCCAAACTCTTGtcaccctagtta > 2:351298/1‑289 (MQ=17) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCAACCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTa > 1:443746/1‑300 (MQ=255) ctgcAAAGGACAGACCACCCAGGCGGTAAGAGCTCAGTTTTTAGAGCACGGCCTTGCCAAGGTCCGGGTCGCGAGTTCTATTCTCGTTTCCCGCTCCAAACTTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGGTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTTTAAACAGAGTTATcc < 2:335430/300‑1 (MQ=21) ctgcAAAGCACAGACCACCCAAGCTGGAATAACTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGTTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTCCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTACTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATcc < 2:216482/300‑1 (MQ=255) cggcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCGCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATcc < 2:510781/298‑1 (MQ=255) cgaaagcaaaattaattagtacgCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATcc < 1:854718/278‑1 (MQ=255) gaGCACAGACCACCCAAGCTGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCGTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTNGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTNGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGc < 2:562189/299‑1 (MQ=255) agcccaGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGCGCTGCAAGGCACAGACCAACCAAGTGGGGATATATCAGTTGGTAGAGCCCGCCATTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCTCTTCCCGCTCCAAATTCTTATCCCCATCAAATACCCACAATGACATGATGCGTTATTGTTGGTGTTTGCTGTCTCTGACAAACTCTTGTAACCAGAGTTATCCACAGcc > 2:73307/5‑300 (MQ=17) gCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAGTTTGCAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGACAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAATCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATTCACAGCGACGCGCTGTGTTATTGTTGGTTTGTGTTGTCTCTGCCAAACTCTTGTAACCAGGGTTATCCACAGCCt > 2:181319/1‑300 (MQ=18) gCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCt > 1:138688/1‑300 (MQ=255) gACCACCCAAGCTGGAAGAGCTCATTTGGTAGAGCACGACCGTGCCAAGGTCGGNGTCGCGAGTTCGATTCTCGTTTCCCCCTCCAAAATTTGAAAGTACTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGNTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 2:780598/300‑1 (MQ=25) gACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGANCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTNCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 2:668590/300‑1 (MQ=255) gACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 1:354276/300‑1 (MQ=255) gACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTGGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 1:522251/300‑1 (MQ=255) gACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTGCCCGCTCCAAAATTTGAGAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 2:126772/300‑1 (MQ=255) ccaccCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCATCAGGCTg > 1:715140/1‑300 (MQ=255) cccAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTaa > 1:793367/1‑300 (MQ=255) ccaggCGGAAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGTGTCGCGAGTGCGAGTCCCGTTTCCCGCTCCAAAATTTAAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCACGCGGGAATAGCTCAGTTNGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCAATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAAt < 2:192780/296‑1 (MQ=21) aGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTTGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCCTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCTCTCCCAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAACGACGCGCTGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACCGAGTTATCCACAGcatagagctttagtctt > 2:312381/1‑284 (MQ=21) aGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTAAGGCTGTAATCtt > 1:297959/1‑300 (MQ=255) ggAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAAtt > 1:443446/1‑300 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTTAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATACAATATCCACAGCGACGCGATGTGTTCTTGTTGGTTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTCATCTTAAttcccacg > 2:4606/1‑294 (MQ=21) 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tCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAAccc < 2:398663/300‑1 (MQ=255) cccGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTCCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCt < 2:807032/300‑1 (MQ=255) aaaTTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAAt > 1:276570/1‑300 (MQ=255) | CAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCC‑GCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAAT > NC_000913/4392372‑4392957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |