| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,668,262 | IS2 (–) +5 bp | coding (299‑303/1221 nt) | mlc ← | DNA‑binding transcriptional repressor Mlc |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 117 (1.090) | 77/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1668266 | 0 (0.000) | coding (299/1221 nt) | mlc | DNA‑binding transcriptional repressor Mlc | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 90 (0.840) | 60/598 | 0.5 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1668262 = | 0 (0.000) | coding (303/1221 nt) | mlc | DNA‑binding transcriptional repressor Mlc | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
ATCGTCCATGCGCTGATATCATGCTGAATATAAACCGGAACGCCGGTATGCTGCTCCAGCGCCTCGCCGAGCGGCATCTCTTTTACATCCTCGTAGAACGGCATGCGATGTACAATACCATTTTCCGTATCAATAATTCCCGGCAAGGTTATGGCAATCGAAGTTAGACGCTCAAGTTTTTTCTGGTGGCGGATAAAAAACTGATCGATATGGGAAATAATACGATCCAGCAATGGCAAGTCATCTTTTAACGCCAGTTCCTGCGACTCTTCCACCACCAGTTTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAACCACCAGCCCCACCGCCGGACGGCCACGGTTCCCCGCTTCTTTGATTTCCAGCTCTTGCACCAGGTGTGCTTCGAGCATCTCACGGACAATTTTAGTGATACTGGCAGGAGCCAGTTGCGCCAGACGGGAAAGATCGATACGCGAGACTGGACCAAGCTGATCAATCAGGCGATAAACCGCGCCCGCGTTGGTCTGCTTTATTTGATCAATGTGCCCAGGCTGGTTTTCA > NC_000913/1667963‑1668556 | aTCGTCCATGCGCTGATATCATGCTGAATATAAACCGGAACGCCGGTATGCTGCTCCAGCGCCTCGCCGAGCGGCATCTCTTTTACATCCTCGTAGAACGGCATGCGATNTACAATACCATTTTCCGTATCAATAATTCCCGGCAAGGTTATGGCAATCGAAGTTAGACGCTCAAGTTTTTTCTGGTGGCGGATAAAAAACTGATCGATATGGGAAATAATACGATCCAGCAATGGCAAGTCATCTTTTAACGCCAGTTCCTGCGACTCTTCCACCACCAGTTTGCTGCTCAGATCgcgc < 1:573426/300‑1 (MQ=255) ggaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgaggtagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCag < 1:421951‑M2/3‑1 (MQ=255) ggaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaattgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCag < 1:420170‑M2/3‑1 (MQ=255) ggaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCag < 1:822462‑M2/3‑1 (MQ=255) gaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgtgcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaatttcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCaga < 1:435239‑M2/4‑1 (MQ=255) acaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCAGAGc < 1:827511‑M2/6‑1 (MQ=255) acaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattacttacgccagataaataactggccggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtgtgacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCAGAGc < 2:118284‑M2/6‑1 (MQ=255) 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ccGGTATGCTGCTCCAGCGCCTCGCCGAGCGGCATCTCTTTTACATCCTCGTAGAACGGCATGCGATGTACAATACCATTTTCCGTATCAATAATTCCCGGCAAGGTTATGGCAATCGAAGTTAGACGCTCAAGTTTTTTCTGGTGGCGGATAAAAAACTGATCGATATGGGAAATAATACGATCCAGCAATGGCAAGTCATCTTTTAACGCCAGTTCCTGCGACTCTTCCACCACCAGTTTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 1:14176‑M2/300‑39 (MQ=255) ccGGTATGCTGCTCCAGCGCCTCGCCGAGCGGCATCTCTTTTACATCCTCGTAGAACGGCATGCGATGTACAATACCATTTTCCGTATCAATAATTCCCGGCAAGGTTATGGCAATCGAAGTTAGACGCTCAAGTTTTTTCTGGTGGCGGATAAAAAACTGATCGATATGGGAAATAATACGATCCAGCAATGGCAAGTCATCTTTTAACGCCAGTTCCTGCGACTCTTCCACCACCAGTCTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 1:267412‑M2/300‑39 (MQ=255) ccGGTATGCTGCTCCAGCGCCTCGCCGAGCGGCATCTCTTTTACATCCTAGTAGAACGGCATGCGATGTACAATACCATTTTCCGTATCAATAATTCCCGGCAAGGTTATGGCAATCGAAGTTAGACGCTCAAGTTTTTTCTGGTGGCGGATAAAAAACTGATCGATATGGGAAATAATACGATCCAGCAATGGCAAGTCATCTTTTAACGCCAGTTCCTGCGACTCTTCCACCACCAGTTTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGtggatttgcccatatatttcccgacatctgttctcaat < 1:652280‑M2/300‑39 (MQ=255) 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gaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAacc < 1:323003‑M2/67‑1 (MQ=255) aataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAaccac < 1:360646‑M2/69‑1 (MQ=255) ctggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgcggaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAACCACCAGcc < 1:211167‑M2/74‑1 (MQ=255) 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gatattggttgtcgggagattcagggggccagtctaCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAACCACCAGCCCCACCGCCGGACGGCCACGGTTCCCCGCTTCTTTGATTTCCAGCTCTTGCACCAGGTGTGCTTCGAGCATCTCACGGACAATTTTAGTGATACTGGCAGGAGCCAGTTGCGCCAGACGGGAAAGATCGATACGCGAGACTGGACCAAGCTGATCAATCAGGCGATAAACCGCGCCCGCGTTGGTCTGCtt < 1:72989‑M2/264‑1 (MQ=255) ctTCCACCACCAGTTTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgtggatgccattcgttataatgctcgaacgcctatgcaaggttctttgctgccgttaacccgtatggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggt < 2:76599‑M2/300‑265 (MQ=255) caccaGTTTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGtggatttgcccctatatttccagacntctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtc > 2:634979‑M2/1‑29 (MQ=255) ttcagggggccagtctaCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAACCACCAGCCCCACCGCCGGACGGCCACGGTTCCCCGCTTCTTTGATTTCCAGCTCTTGCACCAGGTGTGCTTCGAGCATCTCACGGACAATTTTAGTGATACTGGCAGGAGCCAGTTGCGCCAGACGGGAAAGATCGATACGCGAGACTGGACCAAGCTGATCAATCAGGCGATAAACCGCGCCCGCGTTGGTCTGCTTTATTTGATCAATGTGCCCa < 1:21820‑M2/283‑1 (MQ=255) ttGCTGCTCAGATCGCGCCGAGtggatttgcccctctatttccagccatctgtcatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatgttcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcccatgcaaggttctttgctgccgttaaaccgtctggtttgggcatgataccgatgtagtcccgctttatcgttttcacgaagctctctactatccagttactctcagaactccgcaccgtcgtgttcttcggttcacgtcccaacat < 2:395311‑M2/300‑279 (MQ=255) ttGCTGCTCAGATCGCGCAGAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacat < 1:310564‑M2/300‑279 (MQ=255) 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ATCGTCCATGCGCTGATATCATGCTGAATATAAACCGGAACGCCGGTATGCTGCTCCAGCGCCTCGCCGAGCGGCATCTCTTTTACATCCTCGTAGAACGGCATGCGATGTACAATACCATTTTCCGTATCAATAATTCCCGGCAAGGTTATGGCAATCGAAGTTAGACGCTCAAGTTTTTTCTGGTGGCGGATAAAAAACTGATCGATATGGGAAATAATACGATCCAGCAATGGCAAGTCATCTTTTAACGCCAGTTCCTGCGACTCTTCCACCACCAGTTTGCTGCTCAGATCGCGCAGAGCAAGGAAAATCTCCCCGCGACTAATGCGCAGAGAAAGATAGTGCCAGGCTTCAGTTTCAACCACCAGCCCCACCGCCGGACGGCCACGGTTCCCCGCTTCTTTGATTTCCAGCTCTTGCACCAGGTGTGCTTCGAGCATCTCACGGACAATTTTAGTGATACTGGCAGGAGCCAGTTGCGCCAGACGGGAAAGATCGATACGCGAGACTGGACCAAGCTGATCAATCAGGCGATAAACCGCGCCCGCGTTGGTCTGCTTTATTTGATCAATGTGCCCAGGCTGGTTTTCA > NC_000913/1667963‑1668556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |