| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,322,868 | G→A | Q27* (CAG→TAG) | trpE ← | anthranilate synthase subunit TrpE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,322,868 | 0 | G | A | 98.4% | 228.4 / ‑3.9 | 64 | Q27* (CAG→TAG) | trpE | anthranilate synthase subunit TrpE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (39/24); total (39/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
GCATAAGCGGGCGTCTTCATCCAGCAGTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTGGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAAT > NC_000913/1322590‑1323160 | gCATAAGCGGGCGTCTTCATCCAGCAGTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCAACTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACGAGTGAAAAAGCGCGGTGGGAtt > 2:33978/1‑300 (MQ=255)gCATAAGCGGGCGTCTTCATCCAGCAGTGGACCGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGAtt > 2:346239/1‑300 (MQ=255) tCTTCATCCAGCAGTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCANGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCCCACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAgcg > 1:485777/1‑300 (MQ=255) tCTTCATCCAGCAGTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAgcg > 1:389389/1‑300 (MQ=255) tCTTCATCCAGCAGTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCAACTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAgcg > 1:589174/1‑300 (MQ=255) gcattGGACGGACAGGGTGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGGGATTGTTCACTTTCCACACCCGCATGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTTTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAgg < 2:312486/296‑1 (MQ=255) gcagTGGACTGACATGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGGGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAgg < 2:558220/300‑1 (MQ=255) gcagTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCAACTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGACGGACGATCCCCACACAAATAGTGAAACAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGACTTCGCAgg > 2:541150/1‑300 (MQ=255) ggACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACTGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTGAGc < 1:371064/300‑1 (MQ=255) aCTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAg < 2:232804/300‑1 (MQ=255) aCTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAg < 1:463938/300‑1 (MQ=255) tGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACNCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACCGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGtt < 2:521592/300‑1 (MQ=255) ggggtAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGTTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGagag < 1:367840/300‑1 (MQ=255) gcgcAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGttt > 1:449475/1‑300 (MQ=255) gcaCACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCGCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTtgtg > 2:694495/1‑300 (MQ=255) tttGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGtt > 1:265223/1‑300 (MQ=255) gATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATtctc < 1:605092/300‑1 (MQ=255) ttCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTc > 2:322431/1‑300 (MQ=255) ttCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTc > 1:248970/1‑300 (MQ=255) 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gtagtGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGAAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTg > 2:283032/1‑300 (MQ=255) gtGCCAGGAGGGTTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGt < 2:651093/300‑1 (MQ=255) tGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTa > 1:256138/1‑300 (MQ=255) gCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTNGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTAt > 1:523460/1‑300 (MQ=255) aggagtGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGGGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTg < 2:184806/300‑1 (MQ=255) aggaggGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTg < 1:346966/300‑1 (MQ=255) 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gTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATacac < 1:267361/300‑1 (MQ=255) ggATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCg > 1:170045/1‑300 (MQ=255) ggATTGTGACAGTGTCAACTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCACACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTCTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCg > 1:229911/1‑300 (MQ=255) 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aaGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCaa > 1:6945/1‑300 (MQ=255) gcgcaCTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGaaa > 1:628715/1‑300 (MQ=255) gTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAGAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGCTTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCtt > 1:119240/1‑300 (MQ=255) gTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCtt > 1:44561/1‑300 (MQ=255) gTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCACACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCANTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCACGTTTCAGGAAGTGCGCAACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCtt > 2:159675/1‑300 (MQ=255) catcTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGa > 2:694762/1‑300 (MQ=255) tcTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGNTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGNCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAAc > 2:578418/1‑300 (MQ=255) gTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTAc > 1:469266/1‑300 (MQ=255) tatCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGNATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGANTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGtt > 2:569308/1‑300 (MQ=255) cTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTTGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGNCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAAc < 2:619770/300‑1 (MQ=255) gCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTa < 1:430641/300‑1 (MQ=255) cGGATTNCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGNGGTTGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAg < 2:591129/300‑1 (MQ=255) cGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGAGTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCGTTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTCTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAg < 2:442017/300‑1 (MQ=255) ccACACAACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGGTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCNCCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAg > 2:621612/1‑300 (MQ=255) cacaACTAGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAat < 1:34036/300‑1 (MQ=255) | GCATAAGCGGGCGTCTTCATCCAGCAGTGGACTGACAGGGGGGAAGCGCAGCACACGGCAGTTTGGTGATTGTTCACTTTCCACACCCGCAGGCAGGGCGTTATCCAGTAGTGCCAGGAGGGCTTCGCCGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTGTCTACCAGCAGCAGGCTTTTTAAATCATCTTTGCTGTCGATATCTGCGGATTCCAGCAGCAGCGTTGCCGGACGATCCCCACACAACTGGTGAAAAAGCGCGGTGGGATTGTCGCGATAAGCGCCTTCGCAGGTTAGCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTGTGTTTGCATTGTTATTCTCTAATTTTGTTCAAAAAAAA‑GCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACGCATGGTGAATACACTGCCCGTTTCAGGAAGTGCGCCACCAACCTTTCAGTACGAAAATTGCTTTCATTGTCGATACCCTTTTTACGTGAACTTGCGTACTAGTTAACTAGTTCGATGATTAATTGTCAACAGCTCATTTCAGAAT > NC_000913/1322590‑1323160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |