| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,045,543 | C→T | R449C (CGT→TGT) | yihF → | DUF945 domain‑containing protein YihF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,045,543 | 0 | C | T | 99.5% | 722.2 / NA | 199 | R449C (CGT→TGT) | yihF | DUF945 domain‑containing protein YihF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (85/113); minor base G (0/1); total (85/114) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
ACCGGTAAGATGGAAGAACGCACTCGGCGAACTAAATGCCAATCTGGATATCAGTATTGCCGACCCAGCCAAATCTTCATCATCCACAAACAAAGATATCAAATCGCTCAATTTTGATGTGAAGTTACCGCTTAATGTCGTCACAGAAACCGCAAAACAGCTTAATTTATCTGAAGGAATGGATGCGGAAAAAGCGCAAAAGCAGGCTGATAAACAAATCAGCGGGATGATGACATTAGGTCAGATGTTTCAGTTAATCACGATTGACAACAATACCGCCTCGCTGCAGCTGCGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCC > NC_000913/4045251‑4045836 | ccGGTAAGATGGAAGAACGCACTCGGCGAACTAAATGCCAATCTGGATATCAGTATTGCCGACCCAGCCAAATCTTCATCATCCACAAACAAAGATATCAAATCGCTCAATTTTGATGTGAAGTTACCGCTTAATGTCGTCACAGAAACCGCAAAACAGCTTAATTTATCTGAAGGAATGGATGCGGAAAAAGCGCAAAAGCAGGCTGATAAACAAATCAGCGGGATGATGACATTAGGTCAGATGTTTCAGTTAATCAGGATTGACAACAATACCGCATCGCTGCAGCTGTGCTATaca > 2:609044/1‑300 (MQ=255) 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cGCTGCAGCTGTGTTATACACCTGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGAc < 2:92784/300‑1 (MQ=255) cGCTGCAGCTGTGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGTTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGAc < 2:268764/300‑1 (MQ=255) cGCTGCAGCTGTGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGAc > 2:420480/1‑300 (MQ=255) cGCTGCAGCTGTGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGAAAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTCATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGATTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAGATCCACATGTACGAc > 2:5495/1‑300 (MQ=255) cTGCAGCTGTGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACCTGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACaa > 2:82549/1‑300 (MQ=255) cTGCAGCTGTGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCNACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACaa > 2:625577/1‑300 (MQ=255) 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ACCGGTAAGATGGAAGAACGCACTCGGCGAACTAAATGCCAATCTGGATATCAGTATTGCCGACCCAGCCAAATCTTCATCATCCACAAACAAAGATATCAAATCGCTCAATTTTGATGTGAAGTTACCGCTTAATGTCGTCACAGAAACCGCAAAACAGCTTAATTTATCTGAAGGAATGGATGCGGAAAAAGCGCAAAAGCAGGCTGATAAACAAATCAGCGGGATGATGACATTAGGTCAGATGTTTCAGTTAATCACGATTGACAACAATACCGCCTCGCTGCAGCTGCGTTATACACCGGGTAAAGTTGTTTTTAACGGACAGGAGATGAGCGAAGAAGAATTTATGTCTCGTGCCGGACGTTTTGTTCATTAAAATACTCACTCGCCTCTGCTCATTCAGAGGCGAGTAAAACTTACTTATTCTGACGCTGTGATGACATGAGAGACGTCAGAAGCCGGTCTTTTTCCTGCCACAATGAGTTCAGCCATTGCTGAAAATGGCGCTTAAAGCTTTTGTCATTGATGTAGTCGCCATGTAACTCATCGGCAATAGGCTGTAAATCCACATGTACGACAATCC > NC_000913/4045251‑4045836 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |