Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,864,262 | C→T | S9S (TCC→TCT) | ygbM → | putative 2‑oxo‑tetronate isomerase YgbM |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,864,262 | 0 | C | T | 99.0% | 332.8 / NA | 96 | S9S (TCC→TCT) | ygbM | putative 2‑oxo‑tetronate isomerase YgbM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (35/60); minor base G (0/1); total (35/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGTGATGCGGATGGGAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCCATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACCGCTCCCGGAGATATTAATGCGGGGGAATGGGGATTATCCGCCCTTCCCGGACGTGAGCACGAAGCACACGCAGACATCGACCTGGCACTGGAATATGCATTGGCGCTCAATTGTGAACAAGTCCATGTGATGGCAGGCG > NC_000913/2863969‑2864557 | tggtgATGCGGATGGGAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGAACGTAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCATCGTTTTGCAGCTAATTTATCTatgatg > 2:692008/1‑300 (MQ=255) gtgATGCGGATGGGAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGtt > 2:443167/1‑300 (MQ=255) gtgATGCGGATGGGAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGAACGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGtt > 2:76269/1‑300 (MQ=255) gATGGGAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAg < 1:688009/300‑1 (MQ=255) gggAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGc < 1:358530/300‑1 (MQ=255) tGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGAACGCAGGTGAAATTGCGGAAGTGAGGAGGTAATGCAAGGCATAGTTTTGAAGCTAATTTATCTATGATGTTCAACGAAGTGCATTTTa > 2:192038/1‑300 (MQ=255) gTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTAt > 1:253619/1‑300 (MQ=255) gTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCAAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGAACGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTac > 1:273773/1‑299 (MQ=255) gCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAAc < 1:407061/300‑1 (MQ=255) ggTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCAGATCCGTCATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCt > 2:361350/1‑300 (MQ=255) gCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAGCGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCTATCCGTCACCTGAACGCAGGTGAAATTGAGGAATTAAGGAGGTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCAACGAAGTGCATTTTATTGAACGCttag > 2:272813/1‑298 (MQ=255) ccTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTcgc > 2:603252/1‑300 (MQ=255) ccTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGAACGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTcgc > 2:602857/1‑300 (MQ=255) attaCCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAANAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGGCCGCCCGATCCNTTATCTGAAAGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAACTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCa > 2:573609/1‑300 (MQ=255) gCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCTATCCGTTATCTGAACGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTAGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCAGGGTTCGAt > 2:131437/1‑300 (MQ=255) aTCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGTAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGc < 1:245020/300‑1 (MQ=255) cGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATTGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGTAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCtg < 1:228735/300‑1 (MQ=255) gCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTTACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCtgt > 1:240205/1‑300 (MQ=255) gCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCtgt > 1:584255/1‑300 (MQ=255) ggATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAAt < 1:611363/300‑1 (MQ=255) ggATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCAGGGTTCGATGCTGTGGAAt > 1:600810/1‑300 (MQ=255) cagcagACAAGCAGGCTGTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAGGAAGCCGACAACAATATGTAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTGATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAAGTTCTGTTTCCCTATAac < 2:33653/300‑1 (MQ=255) gACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTc < 1:700396/300‑1 (MQ=255) tCAGGCTTCTTTACTTGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATAGGGAAGAGCTGCAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCAccc < 2:616827/300‑1 (MQ=255) aTCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTg > 1:606158/1‑300 (MQ=255) aTGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAg < 1:191056/300‑1 (MQ=255) gTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCa > 1:402659/1‑300 (MQ=255) cgtctgaaGCCTGCACGGATCCGCCAACCATCTGGAAGAGCTGGAGGAAACGACAAACCCGACTTTTATTCTCGGGGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGTTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATTCCTCGTTTTTCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCGTCGCCGCAGCGCGAGAAACCGGGTGCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACGGGAGCAAAACCATccggcac < 2:202052/294‑7 (MQ=255) tGCAAGAAGCCGCCGACACTCTGGAAGAGAGGGAGGAAACGGCAAAGCTGACTTNTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTACCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTGAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTc < 2:527479/300‑1 (MQ=255) aagaagCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGTAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCATGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACTCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAAt < 1:705905/300‑1 (MQ=255) tcggagatgtgtataagagacaggCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 1:7169/277‑1 (MQ=255) taagCCGCCAACAAGGTGTAAGGGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTNTCGTTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATGGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAATTATTCCACCCGGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCACCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 2:530091/299‑1 (MQ=255) gaagcttccAATAATAGGGGAGAGCGGGAGGAAAAGGCAAAACTGATTTTTATTCTCGGCGACCGCCCGATCCGGTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAAGGCAATGCCTCGTTTTGCNGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATGGGACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 2:173030/293‑1 (MQ=255) gaagCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCACAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 1:667897/300‑1 (MQ=255) gaagCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGTTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 1:599661/300‑1 (MQ=255) gaagCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 1:22881/300‑1 (MQ=255) gaagCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGATGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGANTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATAc < 1:510976/300‑1 (MQ=255) caacaaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTTCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACCGCTcacg > 1:585458/1‑297 (MQ=255) caaTATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGGCCGCCAGATCAGTTATCTGAACGAAGGTGAAATTGAGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCNAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTNCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGAAACTGGCGCTGTTCAATACCGCTCCCGgag > 2:475591/1‑300 (MQ=255) atatGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGATCGCCGGATCAGTTAGATGAAGGAAGGTGAAGTTGAGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTAGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCAGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTCTAACTACTCCAACCTGCAAATCCAACANCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACTGCTCCCGGAGat > 2:523908/1‑300 (MQ=255) atatGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACCGCTCCCGGAGat < 1:96315/300‑1 (MQ=255) atatGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTCATCTGAACGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAGCCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACCGCTCCCGGAGat > 2:607686/1‑300 (MQ=255) atGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCTATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACCGCTCCCGGAGatat > 1:565567/1‑300 (MQ=255) 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TGGTGATGCGGATGGGAAATGTCCCGCTGGTGCCTTATTACCGACCGGGCGATAAACGCATCGCACAGGATCTGGCGGAACTGGCAGCAGACAATCAGGCTTTTTTACTGGCAAATCATGGCCCAGTGGTTTGCGGTGAAAGCCTGCAAGAAGCCGCCAACAATATGGAAGAGCTGGAGGAAACGGCAAAGCTGATTTTTATTCTCGGTGACCGCCCGATCCGTTATCTGACCGCAGGTGAAATTGCGGAATTAAGGAGTTAATGCAATGCCTCGTTTTGCAGCTAATTTATCCATGATGTTCACCGAAGTGCCTTTTATTGAACGCTTCGCCGCAGCGCGAAAAGCCGGGTTCGATGCTGTGGAATTTCTGTTTCCCTATAACTACTCCACCCTGCAAATCCAAAAGCAACTGGAGCAAAACCATCTGACACTGGCGCTGTTCAATACCGCTCCCGGAGATATTAATGCGGGGGAATGGGGATTATCCGCCCTTCCCGGACGTGAGCACGAAGCACACGCAGACATCGACCTGGCACTGGAATATGCATTGGCGCTCAATTGTGAACAAGTCCATGTGATGGCAGGCG > NC_000913/2863969‑2864557 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |