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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
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tg‑tCTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGTAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGc < 1:334867/300‑1 (MQ=255) tg‑tCTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGc < 1:334880/300‑1 (MQ=255) tCTAATNACCCGCCTCGCAAACTTCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAANATTGAATTATTCACTGTAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCAc < 2:595476/300‑1 (MQ=255) cTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCatt > 2:308458/1‑298 (MQ=255) cTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGNTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCAct > 1:506478/1‑300 (MQ=255) tAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCActg > 2:199590/1‑300 (MQ=255) | TTGGTTTTCGCCGTAGTACTTTCTTGCGCAGTTATATGTATGATTTCATTCAGCGTTTTGCACCGCATTTAACGCGTGATGTCGTTGATGCGGCTGTCGCATTGCGCTCTAATGAAGAAATTGAGGTCATGTTTAAAGATATAAAACTGCCGGAAAAATAATTTCTTGCGTTATTTTCGGCACCTTTTATGTAGCGAAGGTGCCGGAATATATTCTCTTTTGTTACTTATTTCTATACCGTGCACAATATTTTTATCCCTCATATTTATAGGGTAAATTACCTGTAAAGTAGTG‑TCTAATTACCCGCCTCGCAAACTCCAGTTTTCAAATATCTATTTCAGGTCAAAAGATTGAATTATTCACTGGAGACGATTCGTAAATTCGCTGGATTTTTGACTAAAGTTTCTTTAGGATTTGTCTCATCGTATGATTAATTACACCAATCGTTCAACGTCTTGCTGATAAGTGATGGCGATTATATGAGGTTAGCAATGCCTTCTGGAAATCAGGAACCCCGCCGCGATCCTGAATTAAAACGTAAAGCCTGGCTGGCGGTTTTTCTTGGTTCTGCACTTTTCTGGGTGGTTGTCGCACTG > NC_000913/1334669‑1335264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |