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| ? | NC_000913 | = 4353819 | 0 (0.000) | coding (899/1518 nt) | lysU | lysine‑‑tRNA ligase/Ap4A synthetase/Ap3A synthetase | |||||
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agtctaCAGGGTGCGGAACAGTGACTCTGTCAGTTCAATCAAATCGTGGTAATCCGCATACGCCATGTAGAGTTCCATCATTGTGAACTCAGGATTATGGCGAACAGAAATACCTTCATTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACCCGTTCAAAACCGCCTACAACCAGACGTTTCAGATACAGCTCCGGCGCGATACGCAGATACATATCTAAATCCAGAGCATTATGATGGGTAATAAACGGGCGAGCAGATGCCCAAACTGGAATTACCTGCATCATCGGGGTTTCTACTTCCAt > 2:12814‑M2/7‑300 (MQ=255) gtctaCAGGGTGCGGAACAGTGACTCTGTCAGTTCAATCAAATCGTGGTAATCCGCATATGCCATGTAGAGTTCCATCATTGTGAACTCAGGATTATGGCGAACAGAAATACCTTCATTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATCCCCGTTCAAAACCGCCTACAAACAGACGTTTCAGATACAGCTCCGGCGCGATACGCAGATACATATCTAAATCCAGAGCATTATGATGGGTAATAAACGGGCGAGCAGATGCCCAACCTGGAATTACCTGTATCATCGGGGTTTCTACTTCCATa > 2:401159‑M2/6‑300 (MQ=255) gtctaCAGGGTGCGGAACAGTGACTCTGTCAGTTCAATCAAATCGTGGTAATCCGCATACGCCATGTAGAGTTCCATCATTGTGAACTCAGGATTATGGCGAACAGAAATACCTTCATTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACCCGTTCAAAACCGCCTACAACCAGACGTTTCAGATACAGCTCCGGCGCGATACGCAGATACATATCTAAATCCAGAGCATTATGATGGGTAATAAACGGGCGAGCATATGCCCCACCTGGAATTACCTGCATCATCGGGGTTTCTACTTCCATa > 1:625997‑M2/6‑300 (MQ=255) 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GCCAGCGGGGACACTTCTGCCGGATATTCCGTAATAAAGGTTGGCTGAATCAGATGTGCTTCTGCCACTTCATCAAAGATCTCTGTGACAATACGTCCCAACCCCCAGCTTTTCTCTACCGTAATACCGATAGATTCAGCTAATGCTTTAGCAGCATCAAAATTATCCAGGTCGGCCATATCGGTTTCTGGACGATATTTTTTGATTGCTTCGCGCATGGTGAGTTTTTCAAACGGTTTGCCGAAATCAAACACATGCTCGCCATAAGTGACTTTAGTGGTACCCAGAACCTCTTGTGCCAGGGTGCGGAACAGTGACTCTGTCAGTTCAATCAAATCGTGGTAATCCGCATACGCCATGTAGAGTTCCATCATTGTGAACTCAGGATTATGGCGAACAGAAATACCTTCATTACGGAAGTTACGGTTGATTTCGAATACCCGTTCAAAACCGCCTACAACCAGACGTTTCAGATACAGCTCCGGCGCGATACGCAGATACATATCTAAATCCAGAGCATTATGATGGGTAATAAACGGGCGAGCAGATGCCCCACCTGGAATTACCTGCATCATCGGGGTTTCTACTTCCATAAAGC > NC_000913/4353516‑4354113 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |