| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 770,940 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (+329/‑515) | mngB → / → cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome bd‑I subunit 1 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 135 (1.420) | 78/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 770940 = | 0 (0.000) | intergenic (+329/‑518) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome bd‑I subunit 1 | |||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
GCCAGATTGTTGACAAAGGGCGCTTTGTTCATGCCGGATACGGCATGAACGCTTTATTCGGTCTACAAAAGCAGGCAAATTCAATATATTGCAGAGATGATGTAGACACTGGCAAGCGTAGCGCATCAGGTAATTTTGCGTTTATCTTCACTCTCAAGCCACGTATATGTGGCTTTATTTTTAACAAAATAATAACCCTGGGTGAGTTAATTATAATATAATTATAAGTTAACTAAATGTTAATATTGGCGGGGTGGATTTATGCCTTTATTAGTAATCCTGAAACTCTGCGTCGTATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTC > NC_000913/770643‑771238 | gCCAGATTGTTGACAAAGGGCGCTTTGTTCATGCCGGATACGGCATGAACGCTTTATTCGGTCTACAAAAGCAGGCAAATTCAATATATTGCAGAGATGATGTAGACACTGGCAAGCGTAGCGCATCAGGTAATTTTGCGTTTATCTTCACTCTCAAGCCACGTATATGTGGTTTTATTTTTAACAAAATNATAACCCTGGGTGAGTTAATTATAATATAATTATAAGTTAACTAAATGTTAATATTGGCGGGGTGGATTTATGCCTTTATTAGTAATCCTGAAACTCTGCGTCGTATTa > 1:514377/1‑300 (MQ=255) 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GCCAGATTGTTGACAAAGGGCGCTTTGTTCATGCCGGATACGGCATGAACGCTTTATTCGGTCTACAAAAGCAGGCAAATTCAATATATTGCAGAGATGATGTAGACACTGGCAAGCGTAGCGCATCAGGTAATTTTGCGTTTATCTTCACTCTCAAGCCACGTATATGTGGCTTTATTTTTAACAAAATAATAACCCTGGGTGAGTTAATTATAATATAATTATAAGTTAACTAAATGTTAATATTGGCGGGGTGGATTTATGCCTTTATTAGTAATCCTGAAACTCTGCGTCGTATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTC > NC_000913/770643‑771238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |