| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,105,376 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (+83/‑34) | csgC → / → ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1105380 | 0 (0.000) | 87 (0.910) | 61/598 | 0.3 | 100% | intergenic (+87/‑34) | csgC/ymdA | curlin chaperone/uncharacterized protein YmdA |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GTACAAATATTGTCCCTGCGCGAAGGCAGTTCAGGGCAAAGTCAGACGAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCCTCAGTAAAAGTGCAGTAT > NC_000913/1105081‑1105677 | gTACAAATATTGTCCCTGCGCGAAGGCAGTTCAGGGCAAAGTCAGACGAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCt > 1:258687/1‑300 (MQ=255) aaTATTGTCCCTGCGCGAAGGCAGTTCAGGGCAAAGTCAGACGAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGTAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggat < 1:326430‑M1/300‑6 (MQ=255) aaTATTGTCCCTGCGCGAAGGCAGTTCAGGGCAAAGTCAGACGAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggat < 2:69197‑M1/300‑6 (MQ=255) tatTGTCCCTGCGCGAAGGCAGTTCAGGGCAAAGTCAGACGAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCAGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCCGCCAAACTGAAAGTATGGATAATACAACCCTtgggttt > 2:304988‑M1/1‑293 (MQ=255) 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cTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTNAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCNTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCATtggatttgcccctatatttacagacatctgttatcaattaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 2:544130‑M1/1‑227 (MQ=255) cTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCAATTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGANTCTAGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTTAAAGTATGGATAACACAACCCTtgtatttgcccctatatttccagacatctgttgtcacttaagccattacaaacatgatgttgtagaacttccc > 2:174624‑M1/1‑227 (MQ=255) ctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAgtttgtt > 2:126948‑M2/219‑300 (MQ=255) ctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcaattatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAgtttgtt > 1:106857‑M2/219‑300 (MQ=255) ctgctacaccatgttgcagggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTCTTAAACTCTCTTCTGCTCGGCAgtttgtt > 2:217969‑M2/219‑300 (MQ=255) acaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggtcgtctggagattcagggggccagtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACATTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTc > 2:375856‑M2/214‑300 (MQ=255) 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tGAAAGTATGGATAACACAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaac < 1:223962‑M1/300‑277 (MQ=255) gtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCCTCAGTAAAAGt > 1:325736‑M2/6‑300 (MQ=255) gtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCCTAAGTAAAAGt > 1:12336‑M2/6‑300 (MQ=255) gtctaACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATCGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAANGGGGCGTGATCTATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCNTCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTCCTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAAAGCGCAAATAGCTTAAGTAAAagc > 2:601729‑M2/6‑299 (MQ=255) gtctaACCATAAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGAGCAAATAGCATAAGTAAAAGt > 2:105086‑M2/6‑300 (MQ=255) acacAACCCTtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctatgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgggcgaactg > 1:81885‑M1/1‑10 (MQ=255) ccTCAAGGATGACTCATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGTAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCCTAAGTAAAAGTGCAGTAt > 1:26898/1‑300 (MQ=255) ccTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAANTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCAAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCAACCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCNTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCATAAGTAAAAGTGCAGTAt > 2:716859/1‑300 (MQ=255) ccTCAAGGACGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATATTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTTTTTCTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATTGCCAAATTTTGGAACCGGCATGTGAAGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACGGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCTGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCCTCAGTAAAAGTGCAGTAt < 2:224242/300‑1 (MQ=255) | GTACAAATATTGTCCCTGCGCGAAGGCAGTTCAGGGCAAAGTCAGACGAAGCAAGAAAAGACCCTTTCATTGCCTGCTAATCAACCCATTGCTTTGACGAAGTTGAGTTTAAATATTTCCCCGGACGATCGGGTGAAAATAGTTGTTACTGTTTCTGATGGACAGTCACTTCATTTATCACAACAATGGCCGCCCTCTTCAGAAAAGTCTTAATTTGTTGAAATATCGAGCATAAGATGAATCTGGAGAGAATGGTCTGCTGCGAATCAGCCAACCTGAAAGTATGGATAACACAACCCTCAAGGATGACTAATCATTGAGGAAATAGAATAAATGTTCAGACCTTTTTTAAACTCTCTTATGCTCGGCAGTTTGTTTTTTCCTTTTATTGCCATTGCTGGAAGCACCGTGCAAGGGGGCGTGATCCATTTTTATGGCCAAATTGTGGAACCGGCATGTGACGTCAGCACCCAGTCATCACCCGTAGAAATGAACTGCCCACAGAATGGTTCTATTCCGGGCAAAACCTACTCCAGCAAAGCGTTAATGAGCGGCAATGTCAAAAACGCGCAAATAGCCTCAGTAAAAGTGCAGTAT > NC_000913/1105081‑1105677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |