New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 366291 = | 70 (0.740) | 3262 (35.210) +CCAAGCTT |
314/582 | 0.0 | 97.7% | coding (15/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase |
? | NC_000913 | 712964 = | 85 (0.890) | intergenic (‑162/‑23) | ybfF/seqA | esterase/negative modulator of initiation of replication |
Only 100 of 3333 total aligned reads displayed.
CGTTGGTGTAGATGGGCGCATCGTAACCGTGCATCTGCCAGTTTGAGGGGACGACGACAGTATCGGCCTCAGGAAGATCGCACTCCAGCCAGCTTTCCGGCACCGCTTCTGGTGCCGGAAACCAGGCAAAGCGCCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAG > NC_000913/365996‑366590 | cgctcgcttttgctctgcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcancgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCa > 1:514363‑M1/293‑300 (MQ=255) cttttgctctgcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaagatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCa < 2:306949‑M1/14‑1 (MQ=255) cttttgctctgcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaccttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCGTGGTCa < 2:33302‑M1/14‑1 (MQ=255) cttttgctctgcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtattagaagcttggCGTAATCATGGTCa < 1:585596‑M1/14‑1 (MQ=255) tgctctgcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgctgcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggcngtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGc > 2:182530‑M1/283‑300 (MQ=255) tgcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATATCTGttt > 2:251349‑M1/278‑300 (MQ=255) gcgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgccgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcagnctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatangcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTc < 2:615118‑M1/24‑1 (MQ=255) cgtattcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgacctgcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTcc > 1:113857‑M1/276‑300 (MQ=255) ttcatccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCtgtg > 1:294962‑M1/272‑300 (MQ=255) catccgaaagcagaagttcacgcattgcgcgaaccttgtctttaatcgttttgaccggcttcgcttcgacgatagcaggtgacgcaacgcgaacctctttcgtcaccggagcagcaggctgtgatgcggcggaaaatttcaacatacgccgtaaaatgtcggatgcgctctcgccgatatgcttagtgtggctggcaatatagctgtagagttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatcnagtgcagtgtattagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCNtgtgtg < 2:633099‑M1/31‑1 (MQ=255) 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agttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACCATTCCACACAACATATGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTGTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTtgcgtattgggcgctcttccgctt > 1:124465‑M1/61‑290 (MQ=255) agttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGGAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTtgcgtattgggcgctcttccgctt > 1:166299‑M1/61‑290 (MQ=255) agttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtctgagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACNATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTtgcgtattgggcgctcttccgctt > 1:549774‑M1/61‑290 (MQ=255) gttcatcatcaacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTttgcgtattgggcgctcttccgctta < 1:234712‑M1/241‑12 (MQ=255) caacttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATAGGCCAACGCGGGGGGagaggcggtttgcgtattgggcgctcttccgcttcctcgctcac > 1:415067‑M1/51‑280 (MQ=255) cttcaatcgtcttcatcttaatccagtacagtgtcttagaagctgggCGTAATCATGGGCATAGCTATTTCTTGTGTGAGATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATGGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTTTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGgggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttccgcttcctcgctcactga > 2:146054‑M1/48‑277 (MQ=255) ttcaatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGATGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCggggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttccgcttcctcgctcactgac > 1:245168‑M1/47‑276 (MQ=255) caatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGTAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttccgcttcctcgctcactgactc > 1:178590‑M1/45‑274 (MQ=255) caatcgttttcatcttaatccagtgcagtgtcttagaagcttggCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAANGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGNTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgctcttccgcttcctcgctcactgactc > 2:513710‑M1/45‑274 (MQ=255) | CGTTGGTGTAGATGGGCGCATCGTAACCGTGCATCTGCCAGTTTGAGGGGACGACGACAGTATCGGCCTCAGGAAGATCGCACTCCAGCCAGCTTTCCGGCACCGCTTCTGGTGCCGGAAACCAGGCAAAGCGCCATTCGCCATTCAGGCTGCGCAACTGTTGGGAAGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGTTTGCGTATTGGGCGCCAGGGTGGTTTTTCTTTTCACCAGTGAGACGGGCAACAGCTGATTGCCCTTCACCGCCTGGCCCTGAGAG > NC_000913/365996‑366590 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |