Read alignment evidence... | |||||||||||
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTGCTGCGTGGCTCATTTATGTTTATGGCGGACCTGTGCCGTGAAGTTCAGGTATCTCATGAAGTCGACTTTATGACCGCCTCCAGCTACGGTAGCGGCATGTCCACCACCCGTGATGTGAAAATCCTCAAAGATCTGGATGAAGATATCCGTGGCAAGGACGTGCTGATTGTTGAAGATATCATCGACTCGGGGAATACACTGTCGAAAGTGCGTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCG > NC_000913/141551‑142140 | ctgctgCGTGGCTCATTTATGTTTATGGCGGACCTGTGCCGTGAAGTTCAGGTATCTCATGAAGTCGACTTTATGACCGCCTCCAGCTACGGTAGCGGCATGTCCACCACCCGTGATGTGAAAATCCTCAAAGATCTGGATGAAGATATCCGTGGCAAGGACGTGTTGATTGTTGAAGATATCATCGACTCGGGGAATACACTGTCGAAAGTGCGTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTAAAGTGGACGTCCCg > 2:147264/1‑300 (MQ=255) 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gtgaagtgaaCGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGc < 2:357298/300‑1 (MQ=255) tgaagtgaaCGTCCCGTTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGcc < 1:148094/300‑1 (MQ=255) tgaagtgaaCGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGcc < 1:214348/300‑1 (MQ=255) 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CTGCTGCGTGGCTCATTTATGTTTATGGCGGACCTGTGCCGTGAAGTTCAGGTATCTCATGAAGTCGACTTTATGACCGCCTCCAGCTACGGTAGCGGCATGTCCACCACCCGTGATGTGAAAATCCTCAAAGATCTGGATGAAGATATCCGTGGCAAGGACGTGCTGATTGTTGAAGATATCATCGACTCGGGGAATACACTGTCGAAAGTGCGTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAAGTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCG > NC_000913/141551‑142140 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |