| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 1,411,925 | Δ23,060 bp | [ttcA]–ynaM | 34 genes [ttcA], intR, xisR, rcbA, ralA, ralR, recT, recE, racC, ydaE, kilR, kilS, sieB, ydaF, ydaG, racR, ydaS, ydaT, ydaU, ydaV, ydaW, rzoR, trkG, ynaK, ydaY, ynaA, lomR, insH5, lomR, stfR, tfaR, pinR, ynaE, ynaM |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1411925 | 1434984 | 23060 | 121 [0] | [8] 130 | [ttcA]–ynaM | [ttcA],intR,xisR,rcbA,ralA,ralR,recT,recE,racC,ydaE,kilR,kilS,sieB,ydaF,ydaG,racR,ydaS,ydaT,ydaU,ydaV,ydaW,rzoR,trkG,ynaK,ydaY,ynaA,lomR,insH5,lomR,stfR,tfaR,pinR,ynaE,ynaM |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1411924 | 0 (0.000) | 121 (1.220) | 71/546 | 0.2 | 100% | coding (25/936 nt) | ttcA | tRNA cytosine(32) 2‑sulfurtransferase TtcA |
| ? | NC_000913 | 1434985 = | 0 (0.000) | intergenic (‑579/+200) | ynaM/uspF | protein YnaM/universal stress protein F | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GAGGAATGAATGTGATGGGAGTGATGTATCTGAATAGTTGAAAAACCGCAGTCACGTCGTATGCAAGAACGTGCTGCGGTTGGTTTGACTTTGATTGAGACGTTTTGGAATTTTTTTCGGTGGCAAAAATGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTATGGTACGGATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATG > NC_000913/1434686‑1435284 | taagtattctcttcaacaatcttgtactcaacgcccagcttttcaagatactcgggcagaacgtgttccgggaagcccggttgcttttgatcgaggttaacagccaccagcgaaaaattgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagcatggtatagctgtctttacccccggagaggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgaagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgcagacgtttttgtaatttgttcaggttgtattgttctttctta > 1:576887‑M2/300‑300 (MQ=255) 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atcttgtactcaacgcccagcttttcaagatactcgggcagaacgtgttccgggaagcccggttgcttttgatcgaggttaacagccaccagcgaaaaattgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagcatggtatagctgtctttacccccggagaggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgaagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgcagacgtttttgtaatttgttcaggttgtattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGc > 1:313620‑M2/282‑300 (MQ=255) atcttgtactcaacgcccagcttttcaagatactcgggcagaacgtgttccgggaagcccggttgcttttgatcgaggttaacagccaccagcgaaaaactgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagcatggtatagctgtctttacccccggagaggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgaagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgcagacgtttttgtagtttgttcaggttgtattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGc > 1:315462‑M2/282‑300 (MQ=255) atcttgtactcaacgcccagctcttcaagatcctcgggcagaacgtgctccgggaagcccggttgcttttgatcgaggttaacagcaacgagcgcaaaattgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagtatggtatagctgtctttacccccggagcggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgaagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgaagacgcttttgtaatttgttcaggctgcattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGc > 2:322567‑M2/282‑300 (MQ=255) 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ttgatcgaggttaacagccaccagcgaaaaattgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagcatggtatagctgtctttacccccggagaggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgaagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgcagacgtttttgtaatttgttcaggttgtattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGc < 1:756328‑M2/87‑1 (MQ=255) aggttaacagccaccagcgaaaaattgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagcatggtatagctgtctttacccccggagaggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgnagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgcagacgtttttgtaatttgttcaggttgtattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGaa < 2:194284‑M2/94‑1 (MQ=255) aggttaacagccaccagcgaaaaattgattggcgcgctttgctgcaaattgcgcagaatctccagcatggtatagctgtctttacccccggagaggcaaaccatgatgcgatcgccttcttcaatcatattgaagtcagcaatggcttcgcccacgttacgacgcagacgtttttgtaatttgttcaggttgtattgttctttcttACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGaa < 2:37939‑M2/94‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |