| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,366,110 | IS1 (+) +8 bp | coding (657‑664/1302 nt) | dcuA ← | C4‑dicarboxylate transporter DcuA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 101 (0.930) | 67/596 | 0.4 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4366110 = | 0 (0.000) | coding (664/1302 nt) | dcuA | C4‑dicarboxylate transporter DcuA | |||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
TCTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAGGTAGCTGATGCCATGACCTTCCATCACGGAAGACATGTAAACCACTGCCGCTGAGATTGGCGATGCGGTGATCGCAATCTGCGCGGATACCACTGCAGTAGACAGCGGACGGCAAGGTTTAACGCCT > NC_000913/4365815‑4366408 | tCTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGgat > 1:777485/1‑300 (MQ=255) cTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGNTCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGgatt > 2:214049/1‑300 (MQ=255) cTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACNTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCNACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAAACAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCCTAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGgatg > 2:585692/1‑299 (MQ=255) gcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacattatcaacaagttggagtcattaccCGGATTTGATTTc > 2:78597‑M2/288‑300 (MQ=255) aGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatg < 1:216207‑M2/300‑8 (MQ=255) gAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactg < 1:104046‑M2/300‑22 (MQ=255) ttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTc > 1:171660‑M2/264‑300 (MQ=255) 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acacCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:150423‑M2/1‑252 (MQ=255) acCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGNTAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 1:636487‑M2/300‑51 (MQ=255) ggATACAAATACAGGCGCTCATACCTGATTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTAAAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAAACAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtggtgctgccaacgtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgttcca < 2:12128‑M2/300‑56 (MQ=255) gATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGTTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 1:825041‑M2/1‑244 (MQ=255) aTACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 1:568115‑M2/300‑58 (MQ=255) aCAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 1:118652‑M2/300‑60 (MQ=255) ccgagatgtgtataagagacagccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAAACAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATaa > 1:720173‑M2/233‑300 (MQ=255) atggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATc < 1:184700‑M2/71‑1 (MQ=255) cTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctat < 1:402103‑M2/300‑73 (MQ=255) 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aaacactatcaataagttggggtcattaccCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTTCGATAAATCGGATCGTCAGATAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGTAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAGGTAGCTGATGCCATGACCTTCCATCACGGAAGACATGTAAACCACTGCCGCTGAGATTGGCGATGCGGTGATCGCAATCTGCGCGGATACCACTGCAg < 2:170558‑M2/270‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAGGTAGCTGATGCCATGACCTTCCATCACGGAAGACATGTAAACCACTGCCGCTGAGATTGGCGATGCGGTGATCGCAATCTGCGCGGATACCACTGCAg < 1:345125‑M2/270‑1 (MQ=255) ctatcaataatttggagtcattaccCGGATTTGATTTCAATCTGCGTGTCACCGCGCAGTTCAACCAGTCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGAGCGTCAGAGAGTTTGGAGTTAAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGGTGACGGGATGACCACTGAGAGCAGATGGAGGTAGCTGATGCCATGACCTTCCATCACGGAAGACATGTAAACCACTGCCGCTGAGATTGGCGATGCGGTGATCGCAATCTGCGCGGATACCACTGCAGTAGAc < 2:410242‑M2/275‑1 (MQ=255) 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TCTTTGATCCAGTCGATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAACAGCCAGACGGACGTTTTTGCACCGGATTTGATTTCAATCTGCTTTTCACCGCGCAGTTCAACCAGGCCCTCTTCCAGACGCTTGCGATAAATCGGATCGTCAGAGAGTTTGGAGTTGAACAGCATAGTGACCAGGAAGGACATCACCAGAACCGCCAGCAGGGTGGACGGGATGACCACGGAGAGCAGATGGAGGTAGCTGATGCCATGACCTTCCATCACGGAAGACATGTAAACCACTGCCGCTGAGATTGGCGATGCGGTGATCGCAATCTGCGCGGATACCACTGCAGTAGACAGCGGACGGCAAGGTTTAACGCCT > NC_000913/4365815‑4366408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |