New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2904163 | 96 (0.880) | 6 (0.060) | 3/540 | 10.3 | 5.5% | intergenic (+789/+584) | ygcE/queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE |
? | NC_000913 | 2904408 = | 120 (1.220) | intergenic (+1034/+339) | ygcE/queE | putative sugar kinase YgcE/putative 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase QueE | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATC > NC_000913/2903864‑2904457 | acTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAacac < 1:560033/300‑1 (MQ=255) cTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACg < 2:264174/300‑1 (MQ=255) ttGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACggg < 1:689184/300‑1 (MQ=255) tggATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTTGCATGGAGAACTATTTTGAACATTAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACggg < 2:111979/298‑1 (MQ=255) tagATTAAACTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACTGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTACTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACggg < 1:272214/298‑1 (MQ=255) tAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATTAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCAc < 1:431279/300‑1 (MQ=255) tttttGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACaaa < 1:749685/300‑1 (MQ=255) 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aTTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCt > 2:776370/1‑300 (MQ=255) ttGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTc < 2:527166/300‑1 (MQ=255) aaCCTCTCTTGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATGACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGttt < 1:249114/300‑1 (MQ=255) 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aTTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTattaatt > 1:202636/1‑300 (MQ=255) ggggAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTcaca > 1:477033/1‑300 (MQ=255) gAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATc > 1:646908/1‑300 (MQ=255) | ACTTTGATTAAATTTAATTTTTTGTATCGATAATTGTGAACCTCTCTGGCATGGAGAACTATTTTGAACATGAGGTGTTACGTGGATATGTTGCTTATTACAAGTACTGCTAATATAAAAACTTGAGAAAGAGATAACGGGTTATATGGTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGACAGAACGGCCTCAGTAGTCTCGTCAGGCTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATC > NC_000913/2903864‑2904457 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |